CD200R1

CD200R1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BFG, 4BFI
Ідентифікатори
Символи	CD200R1, CD200R, HCRTR2, MOX2R, OX2R, CD200 receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607546 MGI: 1889024 HomoloGene: 10957 GeneCards: CD200R1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • immunoglobulin receptor activity • signaling receptor activity • glycosylated region protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • receptor complex • мембрана • external side of plasma membrane • клітинна мембрана • cell surface Біологічний процес • GO:0022415 viral process • regulation of immune response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • heterotypic cell-cell adhesion • GO:0007243 intracellular signal transduction • Fc receptor signaling pathway • regulation of neuroinflammatory response • negative regulation of neuroinflammatory response • negative regulation of neuron death • negative regulation of macrophage migration • negative regulation of T cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	131450	57781
Ensembl	ENSG00000163606	ENSMUSG00000022667
UniProt	Q8TD46	Q9ES57
RefSeq (мРНК)	NM_138806 NM_138939 NM_138940 NM_170780	NM_021325
RefSeq (білок)	NP_620161 NP_620385 NP_620386 NP_740750	NP_067300
Локус (UCSC)	Хр. 3: 112.92 – 112.98 Mb	Хр. 16: 44.59 – 44.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD200R1 (англ. CD200 receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 325 амінокислот, а молекулярна маса — 36 620.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLCPWRTANL		GLLLILTIFL		VAASSSLCMD		EKQITQNYSK		VLAEVNTSWP
VKMATNAVLC		CPPIALRNLI		IITWEIILRG		QPSCTKAYRK		ETNETKETNC
TDERITWVSR		PDQNSDLQIR		PVAITHDGYY		RCIMVTPDGN		FHRGYHLQVL
VTPEVTLFQN		RNRTAVCKAV		AGKPAAQISW		IPEGDCATKQ		EYWSNGTVTV
KSTCHWEVHN		VSTVTCHVSH		LTGNKSLYIE		LLPVPGAKKS		AKLYIPYIIL
TIIILTIVGF		IWLLKVNGCR		KYKLNKTEST		PVVEEDEMQP		YASYTEKNNP
LYDTTNKVKA		SEALQSEVDT		DLHTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Vaine C.A., Soberman R.J. (2014). The CD200-CD200R1 inhibitory signaling pathway: immune regulation and host-pathogen interactions. Adv. Immunol. 121: 191—211. PMID 24388216 DOI:10.1016/B978-0-12-800100-4.00005-2

Див. також

• Хромосома 3