CD300LF

CD300LF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NMS
Ідентифікатори
Символи	CD300LF, CD300f, CLM-1, CLM1, IREM-1, IREM1, IgSF13, LMIR3, NKIR, CD300 molecule like family member f
Зовнішні ІД	OMIM: 609807 MGI: 2442359 HomoloGene: 51396 GeneCards: CD300LF
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylserine binding • interleukin-4 receptor binding • ceramide binding • lipid binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • процес імунної системи • regulation of immune response • negative regulation of mast cell activation • negative regulation of MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • interleukin-13-mediated signaling pathway • positive regulation of interleukin-4-mediated signaling pathway • negative regulation of apoptotic cell clearance • positive regulation of apoptotic cell clearance Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	146722	246746
Ensembl	ENSG00000186074	ENSMUSG00000047798
UniProt	Q8TDQ1	Q6SJQ7
RefSeq (мРНК)	NM_001289082 NM_001289083 NM_001289084 NM_001289085 NM_001289086 NM_001289087 NM_139018	NM_001169153 NM_145634 NM_001347648
RefSeq (білок)	NP_001276011 NP_001276012 NP_001276013 NP_001276014 NP_001276015 NP_001276016 NP_620587	NP_001162624 NP_001334577 NP_663609
Локус (UCSC)	Хр. 17: 74.69 – 74.71 Mb	Хр. 11: 115.01 – 115.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD300LF (англ. CD300 molecule like family member f) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 290 амінокислот, а молекулярна маса — 32 335.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLLTLYLLL		FWLSGYSIVT		QITGPTTVNG		LERGSLTVQC		VYRSGWETYL
KWWCRGAIWR		DCKILVKTSG		SEQEVKRDRV		SIKDNQKNRT		FTVTMEDLMK
TDADTYWCGI		EKTGNDLGVT		VQVTIDPAPV		TQEETSSSPT		LTGHHLDNRH
KLLKLSVLLP		LIFTILLLLL		VAASLLAWRM		MKYQQKAAGM		SPEQVLQPLE
GDLCYADLTL		QLAGTSPQKA		TTKLSSAQVD		QVEVEYVTMA		SLPKEDISYA
SLTLGAEDQE		PTYCNMGHLS		SHLPGRGPEE		PTEYSTISRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Kim E.J., Lee S.M., Suk K., Lee W.H. (2012). CD300a and CD300f differentially regulate the MyD88 and TRIF-mediated TLR signalling pathways through activation of SHP-1 and/or SHP-2 in human monocytic cell lines. Immunology. 135: 226—235. PMID 22043923 DOI:10.1111/j.1365-2567.2011.03528.x

Див. також

• Хромосома 17