CHD1L

CHD1L
Ідентифікатори
Символи	CHD1L, ALC1, CHDL, chromodomain helicase DNA binding protein 1-like, chromodomain helicase DNA binding protein 1 like
Зовнішні ІД	OMIM: 613039 MGI: 1915308 HomoloGene: 11590 GeneCards: CHD1L
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0004003 DNA helicase activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • global genome nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • ремоделювання хроматину • DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9557	68058
Ensembl	ENSG00000131778	ENSMUSG00000028089
UniProt	Q86WJ1	Q9CXF7
RefSeq (мРНК)	NM_001256336 NM_001256337 NM_001256338 NM_001348451 NM_001348452 NM_001348453 NM_001348454 NM_001348455 NM_001348456 NM_001348457 NM_001348458 NM_001348459 NM_001348460 NM_001348461 NM_001348462 NM_001348463 NM_001348464 NM_001348465 NM_001348466 NM_004284 NM_024568	NM_026539
RefSeq (білок)	NP_001243265 NP_001243266 NP_001243267 NP_004275 NP_078844 NP_001335380 NP_001335381 NP_001335382 NP_001335383 NP_001335384 NP_001335385 NP_001335386 NP_001335387 NP_001335388 NP_001335389 NP_001335390 NP_001335391 NP_001335392 NP_001335393 NP_001335394 NP_001335395	NP_080815
Локус (UCSC)	Хр. 1: 147.24 – 147.3 Mb	Хр. 3: 97.47 – 97.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHD1L (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 1 like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 897 амінокислот, а молекулярна маса — 100 984.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERAGATSRG		GQAPGFLLRL		HTEGRAEAAR		VQEQDLRQWG		LTGIHLRSYQ
LEGVNWLAQR		FHCQNGCILG		DEMGLGKTCQ		TIALFIYLAG		RLNDEGPFLI
LCPLSVLSNW		KEEMQRFAPG		LSCVTYAGDK		EERACLQQDL		KQESRFHVLL
TTYEICLKDA		SFLKSFPWSV		LVVDEAHRLK		NQSSLLHKTL		SEFSVVFSLL
LTGTPIQNSL		QELYSLLSFV		EPDLFSKEEV		GDFIQRYQDI		EKESESASEL
HKLLQPFLLR		RVKAEVATEL		PKKTEVVIYH		GMSALQKKYY		KAILMKDLDA
FENETAKKVK		LQNILSQLRK		CVDHPYLFDG		VEPEPFEVGD		HLTEASGKLH
LLDKLLAFLY		SGGHRVLLFS		QMTQMLDILQ		DYMDYRGYSY		ERVDGSVRGE
ERHLAIKNFG		QQPIFVFLLS		TRAGGVGMNL		TAADTVIFVD		SDFNPQNDLQ
AAARAHRIGQ		NKSVKVIRLI		GRDTVEEIVY		RKAASKLQLT		NMIIEGGHFT
LGAQKPAADA		DLQLSEILKF		GLDKLLASEG		STMDEIDLES		ILGETKDGQW
VSDALPAAEG		GSRDQEEGKN		HMYLFEGKDY		SKEPSKEDRK		SFEQLVNLQK
TLLEKASQEG		RSLRNKGSVL		IPGLVEGSTK		RKRVLSPEEL		EDRQKKRQEA
AAKRRRLIEE		KKRQKEEAEH		KKKMAWWESN		NYQSFCLPSE		ESEPEDLENG
EESSAELDYQ		DPDATSLKYV		SGDVTHPQAG		AEDALIVHCV		DDSGHWGRGG
LFTALEKRSA		EPRKIYELAG		KMKDLSLGGV		LLFPVDDKES		RNKGQDLLAL
IVAQHRDRSN		VLSGIKMAAL		EEGLKKIFLA		AKKKKASVHL		PRIGHATKGF
NWYGTERLIR		KHLAARGIPT		YIYYFPRSKS		AVLHAQSSSS		SSRQLVP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1