CHFR

CHFR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1LGP, 1LGQ, 2XOC, 2XOY, 2XOZ, 2XP0
Ідентифікатори
Символи	CHFR, RNF116, RNF196, checkpoint with forkhead and ring finger domains, E3 ubiquitin protein ligase, checkpoint with forkhead and ring finger domains
Зовнішні ІД	OMIM: 605209 MGI: 2444898 HomoloGene: 10078 GeneCards: CHFR
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity Клітинна компонента • PML body • клітинне ядро Біологічний процес • mitotic cell cycle checkpoint signaling • поділ клітини • GO:0007067 мітоз • клітинний цикл • protein polyubiquitination • modification-dependent protein catabolic process • positive regulation of protein ubiquitination • protein destabilization • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55743	231600
Ensembl	ENSG00000072609	ENSMUSG00000014668
UniProt	Q96EP1	Q810L3
RefSeq (мРНК)	NM_018223 NM_001161344 NM_001161345 NM_001161346 NM_001161347	NM_001289577 NM_001289578 NM_001289579 NM_001289580 NM_172717
RefSeq (білок)	NP_001154816 NP_001154817 NP_001154818 NP_001154819 NP_060693	NP_001276506 NP_001276507 NP_001276508 NP_001276509 NP_766305
Локус (UCSC)	Хр. 12: 132.82 – 132.96 Mb	Хр. 5: 110.28 – 110.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHFR (англ. Checkpoint with forkhead and ring finger domains) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 664 амінокислот, а молекулярна маса — 73 386.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERPEEGKQS		PPPQPWGRLL		RLGAEEGEPH		VLLRKREWTI		GRRRGCDLSF
PSNKLVSGDH		CRIVVDEKSG		QVTLEDTSTS		GTVINKLKVV		KKQTCPLQTG
DVIYLVYRKN		EPEHNVAYLY		ESLSEKQGMT		QESFEANKEN		VFHGTKDTSG
AGAGRGADPR		VPPSSPATQV		CFEEPQPSTS		TSDLFPTASA		SSTEPSPAGR
ERSSSCGSGG		GGISPKGSGP		SVASDEVSSF		ASALPDRKTA		SFSSLEPQDQ
EDLEPVKKKM		RGDGDLDLNG		QLLVAQPRRN		AQTVHEDVRA		AAGKPDKMEE
TLTCIICQDL		LHDCVSLQPC		MHTFCAACYS		GWMERSSLCP		TCRCPVERIC
KNHILNNLVE		AYLIQHPDKS		RSEEDVQSMD		ARNKITQDML		QPKVRRSFSD
EEGSSEDLLE		LSDVDSESSD		ISQPYVVCRQ		CPEYRRQAAQ		PPHCPAPEGE
PGAPQALGDA		PSTSVSLTTA		VQDYVCPLQG		SHALCTCCFQ		PMPDRRAERE
QDPRVAPQQC		AVCLQPFCHL		YWGCTRTGCY		GCLAPFCELN		LGDKCLDGVL
NNNSYESDIL		KNYLATRGLT		WKNMLTESLV		ALQRGVFLLS		DYRVTGDTVL
CYCCGLRSFR		ELTYQYRQNI		PASELPVAVT		SRPDCYWGRN		CRTQVKAHHA
MKFNHICEQT		RFKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Scolnick D.M., Halazonetis T.D. (2000). Chfr defines a mitotic stress checkpoint that delays entry into metaphase. Nature. 406: 430—435. PMID 10935642 DOI:10.1038/35019108
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kang D., Chen J., Wong J., Fang G. (2002). The checkpoint protein Chfr is a ligase that ubiquitinates Plk1 and inhibits Cdc2 at the G2 to M transition. J. Cell Biol. 156: 249—259. PMID 11807090 DOI:10.1083/jcb.200108016
• Bothos J., Summers M.K., Venere M., Scolnick D.M., Halazonetis T.D. (2003). The Chfr mitotic checkpoint protein functions with Ubc13-Mms2 to form Lys63-linked polyubiquitin chains. Oncogene. 22: 7101—7107. PMID 14562038 DOI:10.1038/sj.onc.1206831
• Erson A.E., Petty E.M. (2004). CHFR-associated early G2/M checkpoint defects in breast cancer cells. Mol. Carcinog. 39: 26—33. PMID 14694445 DOI:10.1002/mc.10161
• Daniels M.J., Marson A., Venkitaraman A.R. (2004). PML bodies control the nuclear dynamics and function of the CHFR mitotic checkpoint protein. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 1114—1121. PMID 15467728 DOI:10.1038/nsmb837

Див. також

• Хромосома 12