CHIA

CHIA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YBT, 2YBU, 3FXY, 3FY1, 3RM4, 3RM8, 3RM9, 3RME
Ідентифікатори
Символи	CHIA, AMCASE, CHIT2, TSA1902, chitinase, acidic, chitinase acidic
Зовнішні ІД	OMIM: 606080 MGI: 1932052 HomoloGene: 75168 GeneCards: CHIA
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds • hydrolase activity, acting on glycosyl bonds • kinase binding • chitin binding • hydrolase activity • lysozyme activity • carbohydrate binding • chitinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • цитоплазма Біологічний процес • chitin metabolic process • процес імунної системи • травлення • cell wall chitin metabolic process • production of molecular mediator involved in inflammatory response • chitin catabolic process • response to fungus • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • polysaccharide catabolic process • обмін речовин • inflammatory response • GO:0097285 апоптоз • polysaccharide digestion • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27159	81600
Ensembl	ENSG00000134216	ENSMUSG00000062778
UniProt	Q9BZP6	Q91XA9
RefSeq (мРНК)	NM_001040623 NM_001258001 NM_001258002 NM_001258003 NM_001258004 NM_001258005 NM_021797 NM_201653	NM_023186
RefSeq (білок)	NP_001035713 NP_001244930 NP_001244931 NP_001244932 NP_001244933 NP_001244934 NP_068569 NP_970615	NP_075675
Локус (UCSC)	Хр. 1: 111.29 – 111.32 Mb	Хр. 3: 106.02 – 106.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHIA (англ. Chitinase, acidic) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 52 271.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTKLILLTGL		VLILNLQLGS		AYQLTCYFTN		WAQYRPGLGR		FMPDNIDPCL
CTHLIYAFAG		RQNNEITTIE		WNDVTLYQAF		NGLKNKNSQL		KTLLAIGGWN
FGTAPFTAMV		STPENRQTFI		TSVIKFLRQY		EFDGLDFDWE		YPGSRGSPPQ
DKHLFTVLVQ		EMREAFEQEA		KQINKPRLMV		TAAVAAGISN		IQSGYEIPQL
SQYLDYIHVM		TYDLHGSWEG		YTGENSPLYK		YPTDTGSNAY		LNVDYVMNYW
KDNGAPAEKL		IVGFPTYGHN		FILSNPSNTG		IGAPTSGAGP		AGPYAKESGI
WAYYEICTFL		KNGATQGWDA		PQEVPYAYQG		NVWVGYDNIK		SFDIKAQWLK
HNKFGGAMVW		AIDLDDFTGT		FCNQGKFPLI		STLKKALGLQ		SASCTAPAQP
IEPITAAPSG		SGNGSGSSSS		GGSSGGSGFC		AVRANGLYPV		ANNRNAFWHC
VNGVTYQQNC		QAGLVFDTSC		DCCNWA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, глікозидаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, запальна відповідь, вуглеводний обмін, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі. Також секретований назовні.

Література

• Saito A., Ozaki K., Fujiwara T., Nakamura Y., Tanigami A. (1999). Isolation and mapping of a human lung-specific gene, TSA1902, encoding a novel chitinase family member. Gene. 239: 325—331. PMID 10548734 DOI:10.1016/S0378-1119(99)00394-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1