CHID1

CHID1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BXW
Ідентифікатори
Символи	CHID1, SI-CLP, SICLP, GL008, chitinase domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615692 MGI: 1915288 HomoloGene: 12229 GeneCards: CHID1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oligosaccharide binding • chitinase activity • chitin binding Клітинна компонента • late endosome • trans-Golgi network • екзосома • мембрана • клітинне ядро • лізосома • extracellular region • міжклітинний простір • lysosomal lumen Біологічний процес • вроджений імунітет • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • процес імунної системи • platelet degranulation • chitin catabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	66005	68038
Ensembl	ENSG00000177830	ENSMUSG00000025512
UniProt	Q9BWS9	Q922Q9
RefSeq (мРНК)	NM_001142674 NM_001142675 NM_001142676 NM_001142677 NM_023947	NM_001142681 NM_026522 NM_001369350 NM_001369351 NM_001369352
RefSeq (білок)	NP_001136146 NP_001136147 NP_001136148 NP_001136149 NP_076436	NP_001136153 NP_080798 NP_001356279 NP_001356280 NP_001356281
Локус (UCSC)	Хр. 11: 0.87 – 0.92 Mb	Хр. 7: 141.07 – 141.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CHID1 (англ. Chitinase domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 393 амінокислот, а молекулярна маса — 44 941.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTLFNLLWL		ALACSPVHTT		LSKSDAKKAA		SKTLLEKSQF		SDKPVQDRGL
VVTDLKAESV		VLEHRSYCSA		KARDRHFAGD		VLGYVTPWNS		HGYDVTKVFG
SKFTQISPVW		LQLKRRGREM		FEVTGLHDVD		QGWMRAVRKH		AKGLHIVPRL
LFEDWTYDDF		RNVLDSEDEI		EELSKTVVQV		AKNQHFDGFV		VEVWNQLLSQ
KRVGLIHMLT		HLAEALHQAR		LLALLVIPPA		ITPGTDQLGM		FTHKEFEQLA
PVLDGFSLMT		YDYSTAHQPG		PNAPLSWVRA		CVQVLDPKSK		WRSKILLGLN
FYGMDYATSK		DAREPVVGAR		YIQTLKDHRP		RMVWDSQASE		HFFEYKKSRS
GRHVVFYPTL		KSLQVRLELA		RELGVGVSIW		ELGQGLDYFY		DLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у лізосомі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11