CHTOP

CHTOP
Ідентифікатори
Символи	CHTOP, C1orf77, FL-SRAG, FOP, SRAG, SRAG-3, SRAG-5, pp7704, chromatin target of PRMT1, C10orf77
Зовнішні ІД	OMIM: 614206 HomoloGene: 134556 GeneCards: CHTOP
Онтологія гена Молекулярна функція • methyl-CpG binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • ядерце • transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • mRNA transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of ATP-dependent activity • positive regulation of helicase activity • positive regulation of histone methylation • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26097	н/д
Ensembl	ENSG00000160679	н/д
UniProt	Q9Y3Y2	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001206612 NM_001244664 NM_015607 NM_001317077	н/д
RefSeq (білок)	NP_001193541 NP_001231593 NP_001304006 NP_056422	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.63 – 153.65 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

CHTOP (англ. Chromatin target of PRMT1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 248 амінокислот, а молекулярна маса — 26 397.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAQSAPKVV		LKSTTKMSLN		ERFTNMLKNK		QPTPVNIRAS		MQQQQQLASA
RNRRLAQQME		NRPSVQAALK		LKQSLKQRLG		KSNIQARLGR		PIGALARGAI
GGRGLPIIQR		GLPRGGLRGG		RATRTLLRGG		MSLRGQNLLR		GGRAVAPRMG
LRRGGVRGRG		GPGRGGLGRG		AMGRGGIGGR		GRGMIGRGRG		GFGGRGRGRG
RGRGALARPV		LTKEQLDNQL		DAYMSKTKGH		LDAELDAYMA		QTDPETND

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zullo A.J., Michaud M., Zhang W., Grusby M.J. (2009). Identification of the small protein rich in arginine and glycine (SRAG): a newly identified nucleolar protein that can regulate cell proliferation. J. Biol. Chem. 284: 12504—12511. PMID 19254951 DOI:10.1074/jbc.M809436200
• Teng I.F., Wilson S.A. (2013). Mapping interactions between mRNA export factors in living cells. PLoS ONE. 8: E67676—E67676. PMID 23826332 DOI:10.1371/journal.pone.0067676

Див. також

• Хромосома 1