CLEC4A

CLEC4A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5B1W, 5B1X
Ідентифікатори
Символи	CLEC4A, CLECSF6, DCIR, DDB27, LLIR, CD367, HDCGC13P, C-type lectin domain family 4 member A, hDCIR
Зовнішні ІД	OMIM: 605306 MGI: 1349412 HomoloGene: 49291 GeneCards: CLEC4A
Онтологія гена Молекулярна функція • transmembrane signaling receptor activity • carbohydrate binding • calcium ion binding • mannose binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана Біологічний процес • cell surface receptor signaling pathway • адгезія клітин • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • вроджений імунітет • GO:0032697 negative regulation of cytokine production • plasmacytoid dendritic cell antigen processing and presentation • negative regulation of tumor necrosis factor production • CD8-positive, alpha-beta T cell activation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50856	26888
Ensembl	ENSG00000111729	ENSMUSG00000030148
UniProt	Q9UMR7	Q9QZ15
RefSeq (мРНК)	NM_016184 NM_194447 NM_194448 NM_194450	NM_001170332 NM_001170333 NM_011999
RefSeq (білок)	NP_057268 NP_919429 NP_919430 NP_919432	NP_001163803 NP_001163804 NP_036129
Локус (UCSC)	Хр. 12: 8.12 – 8.14 Mb	Хр. 6: 123.08 – 123.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLEC4A (англ. C-type lectin domain family 4 member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 237 амінокислот, а молекулярна маса — 27 512.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSEITYAEV		RFKNEFKSSG		INTASSAASK		ERTAPHKSNT		GFPKLLCASL
LIFFLLLAIS		FFIAFVIFFQ		KYSQLLEKKT		TKELVHTTLE		CVKKNMPVEE
TAWSCCPKNW		KSFSSNCYFI		STESASWQDS		EKDCARMEAH		LLVINTQEEQ
DFIFQNLQEE		SAYFVGLSDP		EGQRHWQWVD		QTPYNESSTF		WHPREPSDPN
ERCVVLNFRK		SPKRWGWNDV		NCLGPQRSVC		EMMKIHL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Richard M., Veilleux P., Rouleau M., Paquin R., Beaulieu A.D. (2002). The expression pattern of the ITIM-bearing lectin CLECSF6 in neutrophils suggests a key role in the control of inflammation. J. Leukoc. Biol. 71: 871—880. PMID 11994513

Див. також

• Хромосома 12