CLIP1

CLIP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CP5, 2CP6, 2E3H, 2E3I, 2E4H, 2HQH, 2QK0, 3E2U, 3RDV
Ідентифікатори
Символи	CLIP1, CLIP, CLIP-170, CLIP170, CYLN1, RSN, CAP-Gly domain containing linker protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 179838 MGI: 1928401 HomoloGene: 74455 GeneCards: CLIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • microtubule binding • microtubule plus-end binding • зв'язування з іоном металу • tubulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • identical protein binding Клітинна компонента • гіалоплазма • ендосома • центросома • cell projection • мембрана • microtubule cytoskeleton • ruffle • microtubule plus-end • macropinosome • cytoplasmic microtubule • мікротрубочка • цитоскелет • Проміжні філаменти • cytoplasmic vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • кінетохор • nuclear envelope • цитоплазма Біологічний процес • microtubule bundle formation • positive regulation of microtubule polymerization • protein transport into plasma membrane raft • GO:0007067 мітоз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6249	56430
Ensembl	ENSG00000130779	ENSMUSG00000049550
UniProt	P30622	Q922J3
RefSeq (мРНК)	NM_001247997 NM_002956 NM_198240 NM_001389291	NM_001291229 NM_019765 NM_001347468 NM_001359220 NM_001359221 NM_001359222 NM_001359223 NM_001359224
RefSeq (білок)	NP_001234926 NP_002947 NP_937883	NP_001278158 NP_001334397 NP_062739 NP_001346149 NP_001346150 NP_001346151 NP_001346152 NP_001346153
Локус (UCSC)	Хр. 12: 122.27 – 122.42 Mb	Хр. 5: 123.58 – 123.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLIP1 (англ. CAP-Gly domain containing linker protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 438 амінокислот, а молекулярна маса — 162 246.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSMLKPSGLK		APTKILKPGS		TALKTPTAVV		APVEKTISSE		KASSTPSSET
QEEFVDDFRV		GERVWVNGNK		PGFIQFLGET		QFAPGQWAGI		VLDEPIGKND
GSVAGVRYFQ		CEPLKGIFTR		PSKLTRKVQA		EDEANGLQTT		PASRATSPLC
TSTASMVSSS		PSTPSNIPQK		PSQPAAKEPS		ATPPISNLTK		TASESISNLS
EAGSIKKGER		ELKIGDRVLV		GGTKAGVVRF		LGETDFAKGE		WCGVELDEPL
GKNDGAVAGT		RYFQCQPKYG		LFAPVHKVTK		IGFPSTTPAK		AKANAVRRVM
ATTSASLKRS		PSASSLSSMS		SVASSVSSRP		SRTGLLTETS		SRYARKISGT
TALQEALKEK		QQHIEQLLAE		RDLERAEVAK		ATSHVGEIEQ		ELALARDGHD
QHVLELEAKM		DQLRTMVEAA		DREKVELLNQ		LEEEKRKVED		LQFRVEEESI
TKGDLEQKSQ		ISEDPENTQT		KLEHARIKEL		EQSLLFEKTK		ADKLQRELED
TRVATVSEKS		RIMELEKDLA		LRVQEVAELR		RRLESNKPAG		DVDMSLSLLQ
EISSLQEKLE		VTRTDHQREI		TSLKEHFGAR		EETHQKEIKA		LYTATEKLSK
ENESLKSKLE		HANKENSDVI		ALWKSKLETA		IASHQQAMEE		LKVSFSKGLG
TETAEFAELK		TQIEKMRLDY		QHEIENLQNQ		QDSERAAHAK		EMEALRAKLM
KVIKEKENSL		EAIRSKLDKA		EDQHLVEMED		TLNKLQEAEI		KVKELEVLQA
KCNEQTKVID		NFTSQLKATE		EKLLDLDALR		KASSEGKSEM		KKLRQQLEAA
EKQIKHLEIE		KNAESSKASS		ITRELQGREL		KLTNLQENLS		EVSQVKETLE
KELQILKEKF		AEASEEAVSV		QRSMQETVNK		LHQKEEQFNM		LSSDLEKLRE
NLADMEAKFR		EKDEREEQLI		KAKEKLENDI		AEIMKMSGDN		SSQLTKMNDE
LRLKERDVEE		LQLKLTKANE		NASFLQKSIE		DMTVKAEQSQ		QEAAKKHEEE
KKELERKLSD		LEKKMETSHN		QCQELKARYE		RATSETKTKH		EEILQNLQKT
LLDTEDKLKG		AREENSGLLQ		ELEELRKQAD		KAKAAQTAED		AMQIMEQMTK
EKTETLASLE		DTKQTNAKLQ		NELDTLKENN		LKNVEELNKS		KELLTVENQK
MEEFRKEIET		LKQAAAQKSQ		QLSALQEENV		KLAEELGRSR		DEVTSHQKLE
EERSVLNNQL		LEMKKRESKF		IKDADEEKAS		LQKSISITSA		LLTEKDAELE
KLRNEVTVLR		GENASAKSLH		SVVQTLESDK		VKLELKVKNL		ELQLKENKRQ
LSSSSGNTDT		QADEDERAQE		SQIDFLNSVI		VDLQRKNQDL		KMKVEMMSEA
ALNGNGDDLN		NYDSDDQEKQ		SKKKPRLFCD		ICDCFDLHDT		EDCPTQAQMS
EDPPHSTHHG		SRGEERPYCE		ICEMFGHWAT		NCNDDETF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах.

Література

• Pierre P., Scheel J., Rickard J.E., Kreis T.E. (1992). CLIP-170 links endocytic vesicles to microtubules. Cell. 70: 887—900. PMID 1356075 DOI:10.1016/0092-8674(92)90240-D
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Slep K.C., Vale R.D. (2007). Structural basis of microtubule plus end tracking by XMAP215, CLIP-170, and EB1. Mol. Cell. 27: 976—991. PMID 17889670 DOI:10.1016/j.molcel.2007.07.023
• Hayashi I., Plevin M.J., Ikura M. (2007). CLIP170 autoinhibition mimics intermolecular interactions with p150Glued or EB1. Nat. Struct. Mol. Biol. 14: 980—981. PMID 17828275 DOI:10.1038/nsmb1299

Див. також

• Хромосома 12