CLPB

CLPB
Ідентифікатори
Символи	CLPB, HSP78, SKD3, ANKCLB, MEGCANN, MGCA7, ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit B, SCN9, MGCA7A
Зовнішні ІД	OMIM: 616254 MGI: 1100517 HomoloGene: 32067 GeneCards: CLPB
Пов'язані генетичні захворювання
3-methylglutaconic aciduria with cataracts, neurologic involvement and neutropenia
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • молекулярна функція Клітинна компонента • мітохондрія • компонент клітини Біологічний процес • cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81570	20480
Ensembl	ENSG00000162129	ENSMUSG00000001829
UniProt	Q9H078	Q60649
RefSeq (мРНК)	NM_001258392 NM_001258393 NM_001258394 NM_030813	NM_009191 NM_001363991
RefSeq (білок)	NP_001245321 NP_001245322 NP_001245323 NP_110440	NP_033217 NP_001350920
Локус (UCSC)	Хр. 11: 72.29 – 72.43 Mb	Хр. 7: 101.31 – 101.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLPB (англ. ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 707 амінокислот, а молекулярна маса — 78 729.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLGSLVLRRK		ALAPRLLLRL		LRSPTLRGHG		GASGRNVTTG		SLGEPQWLRV
ATGGRPGTSP		ALFSGRGAAT		GGRQGGRFDT		KCLAAATWGR		LPGPEETLPG
QDSWNGVPSR		AGLGMCALAA		ALVVHCYSKS		PSNKDAALLE		AARANNMQEV
SRLLSEGADV		NAKHRLGWTA		LMVAAINRNN		SVVQVLLAAG		ADPNLGDDFS
SVYKTAKEQG		IHSLEDGGQD		GASRHITNQW		TSALEFRRWL		GLPAGVLITR
EDDFNNRLNN		RASFKGCTAL		HYAVLADDYR		TVKELLDGGA		NPLQRNEMGH
TPLDYAREGE		VMKLLRTSEA		KYQEKQRKRE		AEERRRFPLE		QRLKEHIIGQ
ESAIATVGAA		IRRKENGWYD		EEHPLVFLFL		GSSGIGKTEL		AKQTAKYMHK
DAKKGFIRLD		MSEFQERHEV		AKFIGSPPGY		VGHEEGGQLT		KKLKQCPNAV
VLFDEVDKAH		PDVLTIMLQL		FDEGRLTDGK		GKTIDCKDAI		FIMTSNVASD
EIAQHALQLR		QEALEMSRNR		IAENLGDVQI		SDKITISKNF		KENVIRPILK
AHFRRDEFLG		RINEIVYFLP		FCHSELIQLV		NKELNFWAKR		AKQRHNITLL
WDREVADVLV		DGYNVHYGAR		SIKHEVERRV		VNQLAAAYEQ		DLLPGGCTLR
ITVEDSDKQL		LKSPELPSPQ		AEKRLPKLRL		EIIDKDSKTR		RLDIRAPLHP
EKVCNTI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11