CNOT10

CNOT10
Ідентифікатори
Символи	CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10
Зовнішні ІД	MGI: 1926143 HomoloGene: 41040 GeneCards: CNOT10
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • Сайленсинг генів • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of translation • transcription, DNA-templated • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • mRNA catabolic process • negative regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25904	78893
Ensembl	ENSG00000182973	ENSMUSG00000056167
UniProt	Q9H9A5	Q8BH15
RefSeq (мРНК)	NM_001256741 NM_001256742 NM_015442 NM_001393366 NM_001393367 NM_001393368 NM_001393369	NM_153585
RefSeq (білок)	NP_001243670 NP_001243671 NP_056257	NP_705813
Локус (UCSC)	Хр. 3: 32.69 – 32.77 Mb	Хр. 9: 114.59 – 114.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNOT10 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 744 амінокислот, а молекулярна маса — 82 310.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAADKPADQG		AEKHEGTGQS		SGITDQEKEL		STNAFQAFTS		GNYDACLQHL
ACLQDINKDD		YKIILNTAVA		EFFKSNQTTT		DNLRQTLNQL		KNQVHSAVEE
MDGLDDVENS		MLYYNQAVIL		YHLRQYTEAI		SVGEKLYQFI		EPFEEKFAQA
VCFLLVDLYI		LTYQAEKALH		LLAVLEKMIS		QGNNNKNGKN		ETGNNNNKDG
SNHKAESGAL		IEAAKSKIHQ		YKVRAYIQMK		SLKACKREIK		SVMNTAGNSA
PSLFLKSNFE		YLRGNYRKAV		KLLNSSNIAE		HPGFMKTGEC		LRCMFWNNLG
CIHFAMSKHN		LGIFYFKKAL		QENDNVCAQL		SAGSTDPGKK		FSGRPMCTLL
TNKRYELLYN		CGIQLLHIGR		PLAAFECLIE		AVQVYHANPR		LWLRLAECCI
AANKGTSEQE		TKGLPSKKGI		VQSIVGQGYH		RKIVLASQSI		QNTVYNDGQS
SAIPVASMEF		AAICLRNALL		LLPEEQQDPK		QENGAKNSNQ		LGGNTESSES
SETCSSKSHD		GDKFIPAPPS		SPLRKQELEN		LKCSILACSA		YVALALGDNL
MALNHADKLL		QQPKLSGSLK		FLGHLYAAEA		LISLDRISDA		ITHLNPENVT
DVSLGISSNE		QDQGSDKGEN		EAMESSGKRA		PQCYPSSVNS		ARTVMLFNLG
SAYCLRSEYD		KARKCLHQAA		SMIHPKEVPP		EAILLAVYLE		LQNGNTQLAL
QIIKRNQLLP		AVKTHSEVRK		KPVFQPVHPI		QPIQMPAFTT		VQRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mauxion F., Preve B., Seraphin B. (2013). C2ORF29/CNOT11 and CNOT10 form a new module of the CCR4-NOT complex. RNA Biol. 10: 267—276. PMID 23232451 DOI:10.4161/rna.23065
• Farber V., Erben E., Sharma S., Stoecklin G., Clayton C. (2013). Trypanosome CNOT10 is essential for the integrity of the NOT deadenylase complex and for degradation of many mRNAs. Nucleic Acids Res. 41: 1211—1222. PMID 23221646 DOI:10.1093/nar/gks1133
• Bawankar P., Loh B., Wohlbold L., Schmidt S., Izaurralde E. (2013). NOT10 and C2orf29/NOT11 form a conserved module of the CCR4-NOT complex that docks onto the NOT1 N-terminal domain. RNA Biol. 10: 228—244. PMID 23303381 DOI:10.4161/rna.23018

Див. також

• Хромосома 3