COPE

COPE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5A1V, 5A1Y
Ідентифікатори
Символи	COPE, epsilon-COP, coatomer protein complex subunit epsilon, COPI coat complex subunit epsilon
Зовнішні ІД	OMIM: 606942 MGI: 1891702 HomoloGene: 5254 GeneCards: COPE
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • Golgi membrane • COPI-coated vesicle membrane • transport vesicle • нуклеоплазма • COPI vesicle coat • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • protein transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11316	59042
Ensembl	ENSG00000105669	ENSMUSG00000055681
UniProt	O14579	O89079
RefSeq (мРНК)	NM_007263 NM_199442 NM_199444 NM_001330469 NM_025088	NM_021538
RefSeq (білок)	NP_001317398 NP_009194 NP_955474 NP_955476	NP_067513
Локус (UCSC)	Хр. 19: 18.9 – 18.92 Mb	Хр. 8: 70.76 – 70.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COPE (англ. Coatomer protein complex subunit epsilon) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 308 амінокислот, а молекулярна маса — 34 482.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPPAPGPAS		GGSGEVDELF		DVKNAFYIGS		YQQCINEAQR		VKLSSPERDV
ERDVFLYRAY		LAQRKFGVVL		DEIKPSSAPE		LQAVRMFADY		LAHESRRDSI
VAELDREMSR		SVDVTNTTFL		LMAASIYLHD		QNPDAALRAL		HQGDSLECTA
MTVQILLKLD		RLDLARKELK		RMQDLDEDAT		LTQLATAWVS		LATGGEKLQD
AYYIFQEMAD		KCSPTLLLLN		GQAACHMAQG		RWEAAEGLLQ		EALDKDSGYP
ETLVNLIVLS		QHLGKPPEVT		NRYLSQLKDA		HRSHPFIKEY		QAKENDFDRL
VLQYAPSA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• Shima D.T., Scales S.J., Kreis T.E., Pepperkok R. (1999). Segregation of COPI-rich and anterograde-cargo-rich domains in endoplasmic-reticulum-to-Golgi transport complexes. Curr. Biol. 9: 821—824. PMID 10469566 DOI:10.1016/S0960-9822(99)80365-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19