COPS3

COPS3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4D10, 4D18, 4WSN
Ідентифікатори
Символи	COPS3, CSN3, SGN3, COP9 signalosome subunit 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604665 MGI: 1349409 HomoloGene: 2710 GeneCards: COPS3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • COP9 signalosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • transcription-coupled nucleotide-excision repair • in utero embryonic development • ubiquitin-dependent protein catabolic process • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • GO:0072468 сигнальна трансдукція • response to light stimulus • protein deneddylation • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8533	26572
Ensembl	ENSG00000141030	ENSMUSG00000019373
UniProt	Q9UNS2	O88543
RefSeq (мРНК)	NM_001199125 NM_003653 NM_001316354 NM_001316355 NM_001316356 NM_001316357 NM_001316358	NM_011991
RefSeq (білок)	NP_001186054 NP_001303283 NP_001303284 NP_001303285 NP_001303286 NP_001303287 NP_003644	NP_036121
Локус (UCSC)	Хр. 17: 17.25 – 17.28 Mb	Хр. 11: 59.82 – 59.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COPS3 (англ. COP9 signalosome subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 423 амінокислот, а молекулярна маса — 47 873.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASALEQFVN		SVRQLSAQGQ		MTQLCELINK		SGELLAKNLS		HLDTVLGALD
VQEHSLGVLA		VLFVKFSMPS		VPDFETLFSQ		VQLFISTCNG		EHIRYATDTF
AGLCHQLTNA		LVERKQPLRG		IGILKQAIDK		MQMNTNQLTS		IHADLCQLCL
LAKCFKPALP		YLDVDMMDIC		KENGAYDAKH		FLCYYYYGGM		IYTGLKNFER
ALYFYEQAIT		TPAMAVSHIM		LESYKKYILV		SLILLGKVQQ		LPKYTSQIVG
RFIKPLSNAY		HELAQVYSTN		NPSELRNLVN		KHSETFTRDN		NMGLVKQCLS
SLYKKNIQRL		TKTFLTLSLQ		DMASRVQLSG		PQEAEKYVLH		MIEDGEIFAS
INQKDGMVSF		HDNPEKYNNP		AMLHNIDQEM		LKCIELDERL		KAMDQEITVN
PQFVQKSMGS		QEDDSGNKPS		SYS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Potocki L., Chen K.-S., Lupski J.R. (1999). Subunit 3 of the COP9 signal transduction complex is conserved from plants to humans and maps within the Smith-Magenis syndrome critical region in 17p11.2. Genomics. 57: 180—182. PMID 10191102 DOI:10.1006/geno.1998.5748
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hong X., Xu L.-G., Li X., Zhai Z., Shu H.-B. (2001). CSN3 interacts with IKKgamma and inhibits TNF- but not IL-1-induced NF-kappaB activation. FEBS Lett. 499: 133—136. PMID 11418127 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02535-2
• Hoareau Alves K., Bochard V., Rety S., Jalinot P. (2002). Association of the mammalian proto-oncoprotein Int-6 with the three protein complexes eIF3, COP9 signalosome and 26S proteasome. FEBS Lett. 527: 15—21. PMID 12220626 DOI:10.1016/S0014-5793(02)03147-2
• Van Dartel M., Hulsebos T.J.M. (2004). Amplification and overexpression of genes in 17p11.2 approximately p12 in osteosarcoma. Cancer Genet. Cytogenet. 153: 77—80. PMID 15325100 DOI:10.1016/j.cancergencyto.2004.03.007

Див. також

• Хромосома 17