CPSF1

CPSF1
Ідентифікатори
Символи	CPSF1, CPSF160, HSU37012, P/cl.18, cleavage and polyadenylation specific factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606027 MGI: 2679722 HomoloGene: 40865 GeneCards: CPSF1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding • RNA binding Клітинна компонента • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA processing • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29894	94230
Ensembl	ENSG00000071894	ENSMUSG00000034022
UniProt	Q10570	Q9EPU4
RefSeq (мРНК)	NM_013291	NM_001164173 NM_053193 NM_001361485
RefSeq (білок)	NP_037423	NP_001157645 NP_444423 NP_001348414
Локус (UCSC)	Хр. 8: 144.39 – 144.41 Mb	Хр. 15: 76.48 – 76.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CPSF1 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 443 амінокислот, а молекулярна маса — 160 884.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYAVYKQAHP		PTGLEFSMYC		NFFNNSERNL		VVAGTSQLYV		YRLNRDAEAL
TKNDRSTEGK		AHREKLELAA		SFSFFGNVMS		MASVQLAGAK		RDALLLSFKD
AKLSVVEYDP		GTHDLKTLSL		HYFEEPELRD		GFVQNVHTPR		VRVDPDGRCA
AMLVYGTRLV		VLPFRRESLA		EEHEGLVGEG		QRSSFLPSYI		IDVRALDEKL
LNIIDLQFLH		GYYEPTLLIL		FEPNQTWPGR		VAVRQDTCSI		VAISLNITQK
VHPVIWSLTS		LPFDCTQALA		VPKPIGGVVV		FAVNSLLYLN		QSVPPYGVAL
NSLTTGTTAF		PLRTQEGVRI		TLDCAQATFI		SYDKMVISLK		GGEIYVLTLI
TDGMRSVRAF		HFDKAAASVL		TTSMVTMEPG		YLFLGSRLGN		SLLLKYTEKL
QEPPASAVRE		AADKEEPPSK		KKRVDATAGW		SAAGKSVPQD		EVDEIEVYGS
EAQSGTQLAT		YSFEVCDSIL		NIGPCANAAV		GEPAFLSEEF		QNSPEPDLEI
VVCSGHGKNG		ALSVLQKSIR		PQVVTTFELP		GCYDMWTVIA		PVRKEEEDNP
KGEGTEQEPS		TTPEADDDGR		RHGFLILSRE		DSTMILQTGQ		EIMELDTSGF
ATQGPTVFAG		NIGDNRYIVQ		VSPLGIRLLE		GVNQLHFIPV		DLGAPIVQCA
VADPYVVIMS		AEGHVTMFLL		KSDSYGGRHH		RLALHKPPLH		HQSKVITLCL
YRDLSGMFTT		ESRLGGARDE		LGGRSGPEAE		GLGSETSPTV		DDEEEMLYGD
SGSLFSPSKE		EARRSSQPPA		DRDPAPFRAE		PTHWCLLVRE		NGTMEIYQLP
DWRLVFLVKN		FPVGQRVLVD		SSFGQPTTQG		EARREEATRQ		GELPLVKEVL
LVALGSRQSR		PYLLVHVDQE		LLIYEAFPHD		SQLGQGNLKV		RFKKVPHNIN
FREKKPKPSK		KKAEGGGAEE		GAGARGRVAR		FRYFEDIYGY		SGVFICGPSP
HWLLVTGRGA		LRLHPMAIDG		PVDSFAPFHN		VNCPRGFLYF		NRQGELRISV
LPAYLSYDAP		WPVRKIPLRC		TAHYVAYHVE		SKVYAVATST		NTPCARIPRM
TGEEKEFETI		ERDERYIHPQ		QEAFSIQLIS		PVSWEAIPNA		RIELQEWEHV
TCMKTVSLRS		EETVSGLKGY		VAAGTCLMQG		EEVTCRGRIL		IMDVIEVVPE
PGQPLTKNKF		KVLYEKEQKG		PVTALCHCNG		HLVSAIGQKI		FLWSLRASEL
TGMAFIDTQL		YIHQMISVKN		FILAADVMKS		ISLLRYQEES		KTLSLVSRDA
KPLEVYSVDF		MVDNAQLGFL		VSDRDRNLMV		YMYLPEAKES		FGGMRLLRRA
DFHVGAHVNT		FWRTPCRGAT		EGLSKKSVVW		ENKHITWFAT		LDGGIGLLLP
MQEKTYRRLL		MLQNALTTML		PHHAGLNPRA		FRMLHVDRRT		LQNAVRNVLD
GELLNRYLYL		STMERSELAK		KIGTTPDIIL		DDLLETDRVT		AHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Murthy K.G., Manley J.L. (1995). The 160-kD subunit of human cleavage-polyadenylation specificity factor coordinates pre-mRNA 3'-end formation. Genes Dev. 9: 2672—2683. PMID 7590244 DOI:10.1101/gad.9.21.2672
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• McCracken S., Lambermon M., Blencowe B.J. (2002). SRm160 splicing coactivator promotes transcript 3'-end cleavage. Mol. Cell. Biol. 22: 148—160. PMID 11739730 DOI:10.1128/MCB.22.1.148-160.2002
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
• Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Див. також

• Хромосома 8