CPSF3

CPSF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I7T, 2I7V
Ідентифікатори
Символи	CPSF3, CPSF-73, CPSF73, cleavage and polyadenylation specific factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606029 MGI: 1859328 HomoloGene: 6499 GeneCards: CPSF3
Онтологія гена Молекулярна функція • 5'-3' exonuclease activity • зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • hydrolase activity Клітинна компонента • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage • mRNA processing • mRNA export from nucleus • mRNA polyadenylation • mRNA cleavage • mRNA 3'-end processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • sno(s)RNA 3'-end processing • snoRNA splicing • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51692	54451
Ensembl	ENSG00000119203	ENSMUSG00000054309
UniProt	Q9UKF6	Q9QXK7
RefSeq (мРНК)	NM_016207 NM_001321833 NM_001321834 NM_001321835 NM_001321836	NM_018813 NM_001364372 NM_001364373
RefSeq (білок)	NP_001308762 NP_001308763 NP_001308764 NP_001308765 NP_057291	NP_061283 NP_001351301 NP_001351302
Локус (UCSC)	Хр. 2: 9.42 – 9.47 Mb	Хр. 12: 21.34 – 21.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CPSF3 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 77 486.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAIPAEESD		QLLIRPLGAG		QEVGRSCIIL		EFKGRKIMLD		CGIHPGLEGM
DALPYIDLID		PAEIDLLLIS		HFHLDHCGAL		PWFLQKTSFK		GRTFMTHATK
AIYRWLLSDY		VKVSNISADD		MLYTETDLEE		SMDKIETINF		HEVKEVAGIK
FWCYHAGHVL		GAAMFMIEIA		GVKLLYTGDF		SRQEDRHLMA		AEIPNIKPDI
LIIESTYGTH		IHEKREEREA		RFCNTVHDIV		NRGGRGLIPV		FALGRAQELL
LILDEYWQNH		PELHDIPIYY		ASSLAKKCMA		VYQTYVNAMN		DKIRKQININ
NPFVFKHISN		LKSMDHFDDI		GPSVVMASPG		MMQSGLSREL		FESWCTDKRN
GVIIAGYCVE		GTLAKHIMSE		PEEITTMSGQ		KLPLKMSVDY		ISFSAHTDYQ
QTSEFIRALK		PPHVILVHGE		QNEMARLKAA		LIREYEDNDE		VHIEVHNPRN
TEAVTLNFRG		EKLAKVMGFL		ADKKPEQGQR		VSGILVKRNF		NYHILSPCDL
SNYTDLAMST		VKQTQAIPYT		GPFNLLCYQL		QKLTGDVEEL		EIQEKPALKV
FKNITVIQEP		GMVVLEWLAN		PSNDMYADTV		TTVILEVQSN		PKIRKGAVQK
VSKKLEMHVY		SKRLEIMLQD		IFGEDCVSVK		DDSILSVTVD		GKTANLNLET
RTVECEEGSE		DDESLREMVE		LAAQRLYEAL		TPVH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рибонуклеопротеїнів, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
• Ryan K., Calvo O., Manley J.L. (2004). Evidence that polyadenylation factor CPSF-73 is the mRNA 3' processing endonuclease. RNA. 10: 565—573. PMID 15037765 DOI:10.1261/rna.5214404
• Vethantham V., Rao N., Manley J.L. (2007). Sumoylation modulates the assembly and activity of the pre-mRNA 3' processing complex. Mol. Cell. Biol. 27: 8848—8858. PMID 17923699 DOI:10.1128/MCB.01186-07
• Kolev N.G., Yario T.A., Benson E., Steitz J.A. (2008). Conserved motifs in both CPSF73 and CPSF100 are required to assemble the active endonuclease for histone mRNA 3'-end maturation. EMBO Rep. 9: 1013—1018. PMID 18688255 DOI:10.1038/embor.2008.146
• Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Див. також

• Хромосома 2