CSTF3

CSTF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2OND, 2OOE
Ідентифікатори
Символи	CSTF3, CSTF-77, cleavage stimulation factor subunit 3
Зовнішні ІД	OMIM: 600367 MGI: 1351825 HomoloGene: 1014 GeneCards: CSTF3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA polyadenylation • mRNA cleavage • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • RNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1479	228410
Ensembl	ENSG00000176102	ENSMUSG00000027176
UniProt	Q12996	Q99LI7
RefSeq (мРНК)	NM_001033505 NM_001033506 NM_001326	NM_001037326 NM_145529 NM_177253
RefSeq (білок)	NP_001028677 NP_001028678 NP_001317	NP_001032403 NP_663504 NP_796227
Локус (UCSC)	Хр. 11: 33.08 – 33.16 Mb	Хр. 2: 104.42 – 104.5 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CSTF3 (англ. Cleavage stimulation factor subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 717 амінокислот, а молекулярна маса — 82 922.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGDGATEQA		AEYVPEKVKK		AEKKLEENPY		DLDAWSILIR		EAQNQPIDKA
RKTYERLVAQ		FPSSGRFWKL		YIEAEIKAKN		YDKVEKLFQR		CLMKVLHIDL
WKCYLSYVRE		TKGKLPSYKE		KMAQAYDFAL		DKIGMEIMSY		QIWVDYINFL
KGVEAVGSYA		ENQRITAVRR		VYQRGCVNPM		INIEQLWRDY		NKYEEGINIH
LAKKMIEDRS		RDYMNARRVA		KEYETVMKGL		DRNAPSVPPQ		NTPQEAQQVD
MWKKYIQWEK		SNPLRTEDQT		LITKRVMFAY		EQCLLVLGHH		PDIWYEAAQY
LEQSSKLLAE		KGDMNNAKLF		SDEAANIYER		AISTLLKKNM		LLYFAYADYE
ESRMKYEKVH		SIYNRLLAIE		DIDPTLVYIQ		YMKFARRAEG		IKSGRMIFKK
AREDTRTRHH		VYVTAALMEY		YCSKDKSVAF		KIFELGLKKY		GDIPEYVLAY
IDYLSHLNED		NNTRVLFERV		LTSGSLPPEK		SGEIWARFLA		FESNIGDLAS
ILKVEKRRFT		AFKEEYEGKE		TALLVDRYKF		MDLYPCSASE		LKALGYKDVS
RAKLAAIIPD		PVVAPSIVPV		LKDEVDRKPE		YPKPDTQQMI		PFQPRHLAPP
GLHPVPGGVF		PVPPAAVVLM		KLLPPPICFQ		GPFVQVDELM		EIFRRCKIPN
TVEEAVRIIT		GGAPELAVEG		NGPVESNAVL		TKAVKRPNED		SDEDEEKGAV
VPPVHDIYRA		RQQKRIR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Takagaki Y., Manley J.L. (1994). A subunit of the polyadenylation factor CstF is the human homologue of the Drosophila suppressor of forked protein. Nature. 372: 471—474. PMID 7984242 DOI:10.1038/372471a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takagaki Y., Manley J.L. (2000). Complex protein interactions within the human polyadenylation machinery identify a novel component. Mol. Cell. Biol. 20: 1515—1525. PMID 10669729 DOI:10.1128/MCB.20.5.1515-1525.2000
• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070

Див. також

• Хромосома 11