DCAF13

DCAF13
Ідентифікатори
Символи	DCAF13, GM83, WDSOF1, HSPC064, DDB1 and CUL4 associated factor 13, Sof1
Зовнішні ІД	OMIM: 616196 MGI: 2684929 HomoloGene: 6430 GeneCards: DCAF13
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • estrogen receptor binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • small-subunit processome • центросома • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • ribosome biogenesis • rRNA processing • посттрансляційна модифікація • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25879	223499
Ensembl	ENSG00000164934	ENSMUSG00000022300
UniProt	Q9NV06	Q6PAC3
RefSeq (мРНК)	NM_015420	NM_198606
RefSeq (білок)	NP_056235	NP_941008
Локус (UCSC)	Хр. 8: 103.41 – 103.44 Mb	Хр. 15: 38.98 – 39.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCAF13 (англ. DDB1 and CUL4 associated factor 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 51 402.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVKMLSRNP		DNYVRETKLD		LQRVPRNYDP		ALHPFEVPRE		YIRALNATKL
ERVFAKPFLA		SLDGHRDGVN		CLAKHPEKLA		TVLSGACDGE		VRIWNLTQRN
CIRTIQAHEG		FVRGICTRFC		GTSFFTVGDD		KTVKQWKMDG		PGYGDEEEPL
HTILGKTVYT		GIDHHWKEAV		FATCGQQVDI		WDEQRTNPIC		SMTWGFDSIS
SVKFNPIETF		LLGSCASDRN		IVLYDMRQAT		PLKKVILDMR		TNTICWNPME
AFIFTAANED		YNLYTFDMRA		LDTPVMVHMD		HVSAVLDVDY		SPTGKEFVSA
SFDKSIRIFP		VDKSRSREVY		HTKRMQHVIC		VKWTSDSKYI		MCGSDEMNIR
LWKANASEKL		GVLTSREKAA		KDYNQKLKEK		FQHYPHIKRI		ARHRHLPKSI
YSQIQEQRIM		KEARRRKEVN		RIKHSKPGSV		PLVSEKKKHV		VAVVK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, процесинг рРНК, біогенез рибосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jin J., Arias E.E., Chen J., Harper J.W., Walter J.C. (2006). A family of diverse Cul4-Ddb1-interacting proteins includes Cdt2, which is required for S phase destruction of the replication factor Cdt1. Mol. Cell. 23: 709—721. PMID 16949367 DOI:10.1016/j.molcel.2006.08.010

Див. також

• Хромосома 8