DCAF6

DCAF6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3I7O
Ідентифікатори
Символи	DCAF6, 1200006M05Rik, ARCAP, IQWD1, MSTP055, NRIP, PC326, DDB1 and CUL4 associated factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 610494 MGI: 1921356 HomoloGene: 10199 GeneCards: DCAF6
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclear receptor coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex • focal adhesion • клітинне ядро • гіалоплазма • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • посттрансляційна модифікація • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55827	74106
Ensembl	ENSG00000143164	ENSMUSG00000026571
UniProt	Q58WW2	Q9DC22
RefSeq (мРНК)	NM_001017977 NM_001198956 NM_001198957 NM_018442	NM_028759
RefSeq (білок)	NP_001017977 NP_001185885 NP_001185886 NP_060912 NP_001336702 NP_001336703 NP_001336704 NP_001336705 NP_001336706 NP_001336707 NP_001336708 NP_001336709	NP_083035
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 1: 165.33 – 165.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCAF6 (англ. DDB1 and CUL4 associated factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 860 амінокислот, а молекулярна маса — 96 292.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRGGSYPHL		LWDVRKRSLG		LEDPSRLRSR		YLGRREFIQR		LKLEATLNVH
DGCVNTICWN		DTGEYILSGS		DDTKLVISNP		YSRKVLTTIR		SGHRANIFSA
KFLPCTNDKQ		IVSCSGDGVI		FYTNVEQDAE		TNRQCQFTCH		YGTTYEIMTV
PNDPYTFLSC		GEDGTVRWFD		TRIKTSCTKE		DCKDDILINC		RRAATSVAIC
PPIPYYLAVG		CSDSSVRIYD		RRMLGTRATG		NYAGRGTTGM		VARFIPSHLN
NKSCRVTSLC		YSEDGQEILV		SYSSDYIYLF		DPKDDTAREL		KTPSAEERRE
ELRQPPVKRL		RLRGDWSDTG		PRARPESERE		RDGEQSPNVS		LMQRMSDMLS
RWFEEASEVA		QSNRGRGRSR		PRGGTSQSDI		STLPTVPSSP		DLEVSETAME
VDTPAEQFLQ		PSTSSTMSAQ		AHSTSSPTES		PHSTPLLSSP		DSEQRQSVEA
SGHHTHHQSD		NNNEKLSPKP		GTGEPVLSLH		YSTEGTTTST		IKLNFTDEWS
SIASSSRGIG		SHCKSEGQEE		SFVPQSSVQP		PEGDSETKAP		EESSEDVTKY
QEGVSAENPV		ENHINITQSD		KFTAKPLDSN		SGERNDLNLD		RSCGVPEESA
SSEKAKEPET		SDQTSTESAT		NENNTNPEPQ		FQTEATGPSA		HEETSTRDSA
LQDTDDSDDD		PVLIPGARYR		AGPGDRRSAV		ARIQEFFRRR		KERKEMEELD
TLNIRRPLVK		MVYKGHRNSR		TMIKEANFWG		ANFVMSGSDC		GHIFIWDRHT
AEHLMLLEAD		NHVVNCLQPH		PFDPILASSG		IDYDIKIWSP		LEESRIFNRK
LADEVITRNE		LMLEETRNTI		TVPASFMLRM		LASLNHIRAD		RLEGDRSEGS
GQENENEDEE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Tsai T.C., Lee Y.L., Hsiao W.C., Tsao Y.P., Chen S.L. (2005). NRIP, a novel nuclear receptor interaction protein, enhances the transcriptional activity of nuclear receptors. J. Biol. Chem. 280: 20000—20009. PMID 15784617 DOI:10.1074/jbc.M412169200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jin J., Arias E.E., Chen J., Harper J.W., Walter J.C. (2006). A family of diverse Cul4-Ddb1-interacting proteins includes Cdt2, which is required for S phase destruction of the replication factor Cdt1. Mol. Cell. 23: 709—721. PMID 16949367 DOI:10.1016/j.molcel.2006.08.010

Див. також

• Хромосома 1