DCLRE1A

DCLRE1A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4B87, 5AHR
Ідентифікатори
Символи	DCLRE1A, PSO2, SNM1, SNM1A, DNA cross-link repair 1A
Зовнішні ІД	OMIM: 609682 MGI: 1930042 HomoloGene: 8920 GeneCards: DCLRE1A
Онтологія гена Молекулярна функція • 5'-3' exodeoxyribonuclease activity • damaged DNA binding Клітинна компонента • fibrillar center • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • cellular response to DNA damage stimulus • клітинний цикл • double-strand break repair via nonhomologous end joining • interstrand cross-link repair • protection from non-homologous end joining at telomere • поділ клітини • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9937	55947
Ensembl	ENSG00000198924	ENSMUSG00000025077
UniProt	Q6PJP8	Q9JIC3
RefSeq (мРНК)	NM_001271816 NM_014881	NM_018831 NM_001360437 NM_001360438 NM_001360439
RefSeq (білок)	NP_001258745 NP_055696	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 10: 113.83 – 113.85 Mb	Хр. 19: 56.52 – 56.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCLRE1A (англ. DNA cross-link repair 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 116 400.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLEDISEEDI		WEYKSKRKPK		RVDPNNGSKN		ILKSVEKATD		GKYQSKRSRN
RKRAAEAKEV		KDHEVPLGNA		GCQTSVASSQ		NSSCGDGIQQ		TQDKETTPGK
LCRTQKSQHV		SPKIRPVYDG		YCPNCQMPFS		SLIGQTPRWH		VFECLDSPPR
SETECPDGLL		CTSTIPFHYK		RYTHFLLAQS		RAGDHPFSSP		SPASGGSFSE
TKSGVLCSLE		ERWSSYQNQT		DNSVSNDPLL		MTQYFKKSPS		LTEASEKIST
HIQTSQQALQ		FTDFVENDKL		VGVALRLANN		SEHINLPLPE		NDFSDCEISY
SPLQSDEDTH		DIDEKPDDSQ		EQLFFTESSK		DGSLEEDDDS		CGFFKKRHGP
LLKDQDESCP		KVNSFLTRDK		YDEGLYRFNS		LNDLSQPISQ		NNESTLPYDL
ACTGGDFVLF		PPALAGKLAA		SVHQATKAKP		DEPEFHSAQS		NKQKQVIEES
SVYNQVSLPL		VKSLMLKPFE		SQVEGYLSSQ		PTQNTIRKLS		SENLNAKNNT
NSACFCRKAL		EGVPVGKATI		LNTENLSSTP		APKYLKILPS		GLKYNARHPS
TKVMKQMDIG		VYFGLPPKRK		EEKLLGESAL		EGINLNPVPS		PNQKRSSQCK
RKAEKSLSDL		EFDASTLHES		QLSVELSSER		SQRQKKRCRK		SNSLQEGACQ
KRSDHLINTE		SEAVNLSKVK		VFTKSAHGGL		QRGNKKIPES		SNVGGSRKKT
CPFYKKIPGT		GFTVDAFQYG		VVEGCTAYFL		THFHSDHYAG		LSKHFTFPVY
CSEITGNLLK		NKLHVQEQYI		HPLPLDTECI		VNGVKVVLLD		ANHCPGAVMI
LFYLPNGTVI		LHTGDFRADP		SMERSLLADQ		KVHMLYLDTT		YCSPEYTFPS
QQEVIRFAIN		TAFEAVTLNP		HALVVCGTYS		IGKEKVFLAI		ADVLGSKVGM
SQEKYKTLQC		LNIPEINSLI		TTDMCSSLVH		LLPMMQINFK		GLQSHLKKCG
GKYNQILAFR		PTGWTHSNKF		TRIADVIPQT		KGNISIYGIP		YSEHSSYLEM
KRFVQWLKPQ		KIIPTVNVGT		WKSRSTMEKY		FREWKLEAGY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang X., Richie C., Legerski R.J. (2002). Translation of hSNM1 is mediated by an internal ribosome entry site that upregulates expression during mitosis. DNA Repair. 1: 379—390. PMID 12509242

Див. також

• Хромосома 10