DDX10

DDX10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PL3
Ідентифікатори
Символи	DDX10, HRH-J8, DEAD-box helicase 10, Dbp4
Зовнішні ІД	OMIM: 601235 MGI: 1924841 HomoloGene: 20922 GeneCards: DDX10
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA helicase activity • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding • anterior head development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1662	77591
Ensembl	ENSG00000178105	ENSMUSG00000053289
UniProt	Q13206	Q80Y44
RefSeq (мРНК)	NM_004398	NM_029936
RefSeq (білок)	NP_004389	NP_084212
Локус (UCSC)	Хр. 11: 108.67 – 108.94 Mb	Хр. 9: 53.01 – 53.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX10 (англ. DEAD-box helicase 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 875 амінокислот, а молекулярна маса — 100 888.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKTANSPGS		GARPDPVRSF		NRWKKKHSHR		QNKKKQLRKQ		LKKPEWQVER
ESISRLMQNY		EKINVNEITR		FSDFPLSKKT		LKGLQEAQYR		LVTEIQKQTI
GLALQGKDVL		GAAKTGSGKT		LAFLVPVLEA		LYRLQWTSTD		GLGVLIISPT
RELAYQTFEV		LRKVGKNHDF		SAGLIIGGKD		LKHEAERINN		INILVCTPGR
LLQHMDETVS		FHATDLQMLV		LDEADRILDM		GFADTMNAVI		ENLPKKRQTL
LFSATQTKSV		KDLARLSLKN		PEYVWVHEKA		KYSTPATLEQ		NYIVCELQQK
ISVLYSFLRS		HLKKKSIVFF		SSCKEVQYLY		RVFCRLRPGV		SILALHGRQQ
QMRRMEVYNE		FVRKRAAVLF		ATDIAARGLD		FPAVNWVLQF		DCPEDANTYI
HRAGRTARYK		EDGEALLILL		PSEKAMVQQL		LQKKVPVKEI		KINPEKLIDV
QKKLESILAQ		DQDLKERAQR		CFVSYVRSVY		LMKDKEVFDV		SKLPIPEYAL
SLGLAVAPRV		RFLQKMQKQP		TKELVRSQAD		KVIEPRAPSL		TNDEVEEFRA
YFNEKMSILQ		KGGKRLEGTE		HRQDNDTGNE		EQEEEEDDEE		EMEEKLAKAK
GSQAPSLPNT		SEAQKIKEVP		TQFLDRDEEE		EDADFLKVKR		HNVFGLDLKD
EKTLQKKEPS		KSSIKKKMTK		VAEAKKVMKR		NFKVNKKITF		TDEGELVQQW
PQMQKSAIKD		AEEDDDTGGI		NLHKAKERLQ		EEDKFDKEEY		RKKIKAKHRE
KRLKEREARR		EANKRQAKAK		DEEEAFLDWS		DDDDDDDDGF		DPSTLPDPDK
YRSSEDSDSE		DMENKISDTK		KKQGMKKRSN		SEVEDVGPTS		HNRKKARWDT
LEPLDTGLSL		AEDEELVLHL		LRSQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11