DDX43

DDX43
Ідентифікатори
Символи	DDX43, CT13, HAGE, DEAD-box helicase 43
Зовнішні ІД	OMIM: 606286 MGI: 3642857 HomoloGene: 56814 GeneCards: DDX43
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55510	100048658
Ensembl	ENSG00000080007	ENSMUSG00000070291
UniProt	Q9NXZ2	D3Z6P9
RefSeq (мРНК)	NM_018665	NM_001191044
RefSeq (білок)	NP_061135	NP_001177973
Локус (UCSC)	Хр. 6: 73.39 – 73.42 Mb	Хр. 9: 78.3 – 78.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX43 (англ. DEAD-box helicase 43) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 648 амінокислот, а молекулярна маса — 72 844.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSHHGGAPKA		STWVVASRRS		STVSRAPERR		PAEELNRTGP		EGYSVGRGGR
WRGTSRPPEA		VAAGHEELPL		CFALKSHFVG		AVIGRGGSKI		KNIQSTTNTT
IQIIQEQPES		LVKIFGSKAM		QTKAKAVIDN		FVKKLEENYN		SECGIDTAFQ
PSVGKDGSTD		NNVVAGDRPL		IDWDQIREEG		LKWQKTKWAD		LPPIKKNFYK
ESTATSAMSK		VEADSWRKEN		FNITWDDLKD		GEKRPIPNPT		CTFDDAFQCY
PEVMENIKKA		GFQKPTPIQS		QAWPIVLQGI		DLIGVAQTGT		GKTLCYLMPG
FIHLVLQPSL		KGQRNRPGML		VLTPTRELAL		QVEGECCKYS		YKGLRSVCVY
GGGNRDEQIE		ELKKGVDIII		ATPGRLNDLQ		MSNFVNLKNI		TYLVLDEADK
MLDMGFEPQI		MKILLDVRPD		RQTVMTSATW		PHSVHRLAQS		YLKEPMIVYV
GTLDLVAVSS		VKQNIIVTTE		EEKWSHMQTF		LQSMSSTDKV		IVFVSRKAVA
DHLSSDLILG		NISVESLHGD		REQRDREKAL		ENFKTGKVRI		LIATDLASRG
LDVHDVTHVY		NFDFPRNIEE		YVHRIGRTGR		AGRTGVSITT		LTRNDWRVAS
ELINILERAN		QSIPEELVSM		AERFKAHQQK		REMERKMERP		QGRPKKFH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martelange V.M.F., De Smet C., De Plaen E., Lurquin C., Boon T. (2000). Identification on a human sarcoma of two new genes with tumor-specific expression. Cancer Res. 60: 3848—3855. PMID 10919659

Див. також

• Хромосома 6