DGKD

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
DGKD
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи DGKD, DGKdelta, dgkd-2, diacylglycerol kinase delta, DGK-delta
Зовнішні ІД OMIM: 601826 MGI: 2138334 HomoloGene: 100054 GeneCards: DGKD
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_003648
NM_152879
NM_001377259
NM_177646
RefSeq (білок)
NP_003639
NP_690618
NP_001364188
NP_808314
Локус (UCSC) Хр. 2: 233.35 – 233.47 Mb Хр. 1: 87.78 – 87.87 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

DGKD (англ. Diacylglycerol kinase delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 214 амінокислот, а молекулярна маса — 134 525[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAAAAGAPPPGPPQPPPPPPPEESSDSEPEAEPGSPQKLIRKVSTSGQIR
QKTIIKEGMLTKQNNSFQRSKRRYFKLRGRTLYYAKTAKSIIFDEVDLTD
ASVAESSTKNVNNSFTVITPCRKLILCADNRKEMEDWIAALKTVQNREHF
EPTQYSMDHFSGMHNWYACSHARPTYCNVCREALSGVTSHGLSCEVCKFK
AHKRCAVRATNNCKWTTLASIGKDIIEDADGIAMPHQWLEGNLPVSAKCT
VCDKTCGSVLRLQDWRCLWCKAMVHTSCKESLLTKCPLGLCKVSVIPPTA
LNSIDSDGFWKASCPPSCTSPLLVFVNSKSGDNQGVKFLRRFKQLLNPAQ
VFDLMNGGPHLGLRLFQKFDTFRILVCGGDGSVGWVLSEIDSLNLHKQCQ
LGVLPLGTGNDLARVLGWGSACDDDTQLPQILEKLERASTKMLDRWSVMA
YEAKLPRQASSSTVTEDFSEDSEVQQILFYEDSVAAHLSKILTSDQHSVV
ISSAKVLCETVKDFVARVGKAYEKTTESSEESEVMAKKCSVLKEKLDSLL
KTLDDESQASSSLPNPPPTIAEEAEDGDGSGSICGSTGDRLVASACPARP
QIFRPREQLMLRANSLKKAIRQIIEHTEKAVDEQNAQTQEQEGFVLGLSE
SEEKMDHRVCPPLSHSESFGVPKGRSQRKVSKSPCEKLISKGSLSLGSSA
SLPPQPGSRDGLPALNTKILYPNVRAGMSGSLPGGSVISRLLINADPFNS
EPETLEYYTEKCVMNNYFGIGLDAKISLDFNNKRDEHPEKCRSRTKNMMW
YGVLGTKELLHRTYKNLEQKVLLECDGRPIPLPSLQGIAVLNIPSYAGGT
NFWGGTKEDDTFAAPSFDDKILEVVAVFGSMQMAVSRVIRLQHHRIAQCR
TVKISILGDEGVPVQVDGEAWVQPPGYIRIVHKNRAQTLTRDRAFESTLK
SWEDKQKCELPRPPSCSLHPEMLSEEEATQMDQFGQAAGVLIHSIREIAQ
SHRDMEQELAHAVNASSKSMDRVYGKPRTTEGLNCSFVLEMVNNFRALRS
ETELLLSGKMALQLDPPQKEQLGSALAEMDRQLRRLADTPWLCQSAEPGD
EESVMLDLAKRSRSGKFRLVTKFKKEKNNKNKEAHSSLGAPVHLWGTEEV
AAWLEHLSLCEYKDIFTRHDIRGSELLHLERRDLKDLGVTKVGHMKRILC
GIKELSRSAPAVEA

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
  • Sakane F., Imai S., Kai M., Wada I., Kanoh H. (1996). Molecular cloning of a novel diacylglycerol kinase isozyme with a pleckstrin homology domain and a C-terminal tail similar to those of the EPH family of protein-tyrosine kinases. J. Biol. Chem. 271: 8394—8401. PMID 8626538 DOI:10.1074/jbc.271.14.8394
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Imai S., Sakane F., Kanoh H. (2002). Phorbol ester-regulated oligomerization of diacylglycerol kinase delta linked to its phosphorylation and translocation. J. Biol. Chem. 277: 35323—35332. PMID 12084710 DOI:10.1074/jbc.M202035200
  • Kawasaki T., Kobayashi T., Ueyama T., Shirai Y., Saito N. (2008). Regulation of clathrin-dependent endocytosis by diacylglycerol kinase delta: importance of kinase activity and binding to AP2alpha. Biochem. J. 409: 471—479. PMID 17880279 DOI:10.1042/BJ20070755

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2851 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q16760 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]