DHX29

DHX29
Ідентифікатори
Символи	DHX29, DDX29, DEAH-box helicase 29, DExH-box helicase 29
Зовнішні ІД	OMIM: 612720 HomoloGene: 10387 GeneCards: DHX29
Онтологія гена Молекулярна функція • translation initiation factor activity • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity • ribosomal small subunit binding • cadherin binding • RNA binding • RNA helicase activity • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity Клітинна компонента • цитоплазма • eukaryotic 43S preinitiation complex • мітохондрія Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • translational initiation • Біосинтез білків • positive regulation of translational initiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54505	100362324
Ensembl	ENSG00000067248	ENSRNOG00000010369
UniProt	Q7Z478	D3ZHW0
RefSeq (мРНК)	NM_019030 NM_001345964 NM_001345965	XM_002729007 XM_006231950
RefSeq (білок)	NP_001332893 NP_001332894 NP_061903	XP_002729053 XP_006232012
Локус (UCSC)	Хр. 5: 55.26 – 55.31 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DHX29 (англ. DExH-box helicase 29) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 369 амінокислот, а молекулярна маса — 155 236.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGKNKKHKA		PAAAVVRAAV		SASRAKSAEA		GIAGEAQSKK		PVSRPATAAA
AAAGSREPRV		KQGPKIYSFN		STNDSSGPAN		LDKSILKVVI		NNKLEQRIIG
VINEHKKQNN		DKGMISGRLT		AKKLQDLYMA		LQAFSFKTKD		IEDAMTNTLL
YGGDLHSALD		WLCLNLSDDA		LPEGFSQEFE		EQQPKSRPKF		QSPQIQATIS
PPLQPKTKTY		EEDPKSKPKK		EEKNMEVNMK		EWILRYAEQQ		NEEEKNENSK
SLEEEEKFDP		NERYLHLAAK		LLDAKEQAAT		FKLEKNKQGQ		KEAQEKIRKF
QREMETLEDH		PVFNPAMKIS		HQQNERKKPP		VATEGESALN		FNLFEKSAAA
TEEEKDKKKE		PHDVRNFDYT		ARSWTGKSPK		QFLIDWVRKN		LPKSPNPSFE
KVPVGRYWKC		RVRVIKSEDD		VLVVCPTILT		EDGMQAQHLG		ATLALYRLVK
GQSVHQLLPP		TYRDVWLEWS		DAEKKREELN		KMETNKPRDL		FIAKLLNKLK
QQQQQQQQHS		ENKRENSEDP		EESWENLVSD		EDFSALSLES		ANVEDLEPVR
NLFRKLQSTP		KYQKLLKERQ		QLPVFKHRDS		IVETLKRHRV		VVVAGETGSG
KSTQVPHFLL		EDLLLNEWEA		SKCNIVCTQP		RRISAVSLAN		RVCDELGCEN
GPGGRNSLCG		YQIRMESRAC		ESTRLLYCTT		GVLLRKLQED		GLLSNVSHVI
VDEVHERSVQ		SDFLLIILKE		ILQKRSDLHL		ILMSATVDSE		KFSTYFTHCP
ILRISGRSYP		VEVFHLEDII		EETGFVLEKD		SEYCQKFLEE		EEEVTINVTS
KAGGIKKYQE		YIPVQTGAHA		DLNPFYQKYS		SRTQHAILYM		NPHKINLDLI
LELLAYLDKS		PQFRNIEGAV		LIFLPGLAHI		QQLYDLLSND		RRFYSERYKV
IALHSILSTQ		DQAAAFTLPP		PGVRKIVLAT		NIAETGITIP		DVVFVIDTGR
TKENKYHESS		QMSSLVETFV		SKASALQRQG		RAGRVRDGFC		FRMYTRERFE
GFMDYSVPEI		LRVPLEELCL		HIMKCNLGSP		EDFLSKALDP		PQLQVISNAM
NLLRKIGACE		LNEPKLTPLG		QHLAALPVNV		KIGKMLIFGA		IFGCLDPVAT
LAAVMTEKSP		FTTPIGRKDE		ADLAKSALAM		ADSDHLTIYN		AYLGWKKARQ
EGGYRSEITY		CRRNFLNRTS		LLTLEDVKQE		LIKLVKAAGF		SSSTTSTSWE
GNRASQTLSF		QEIALLKAVL		VAGLYDNVGK		IIYTKSVDVT		EKLACIVETA
QGKAQVHPSS		VNRDLQTHGW		LLYQEKIRYA		RVYLRETTLI		TPFPVLLFGG
DIEVQHRERL		LSIDGWIYFQ		APVKIAVIFK		QLRVLIDSVL		RKKLENPKMS
LENDKILQII		TELIKTENN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як біосинтез білків. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Pisareva V.P., Pisarev A.V., Komar A.A., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2008). Translation initiation on mammalian mRNAs with structured 5'UTRs requires DExH-box protein DHX29. Cell. 135: 1237—1250. PMID 19109895 DOI:10.1016/j.cell.2008.10.037

Див. також

• Хромосома 5