DHX35

DHX35
Ідентифікатори
Символи	DHX35, C20orf15, DDX35, KAIA0875, DEAH-box helicase 35
Зовнішні ІД	MGI: 1918965 HomoloGene: 6406 GeneCards: DHX35
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding • GO:0034459 3'-5' RNA helicase activity Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	60625	71715
Ensembl	ENSG00000101452	ENSMUSG00000027655
UniProt	Q9H5Z1 Q5THQ7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001190809 NM_021931	NM_001291144 NM_145742 NM_001372513
RefSeq (білок)	NP_001177738 NP_068750	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 20: 38.96 – 39.04 Mb	Хр. 2: 158.64 – 158.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DHX35 (англ. DEAH-box helicase 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 703 амінокислот, а молекулярна маса — 78 910.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPVGPVKF		WRPGTEGPGV		SISEERQSLA		ENSGTTVVYN		PYAALSIEQQ
RQKLPVFKLR		NHILYLIENY		QTVVIVGETG		CGKSTQIPQY		LAEAGWTAEG
RVVGVTQPRR		VAAVTVAGRV		AEERGAVLGH		EVGYCIRFDD		CTDQLATRIK
FLTDGMLVRE		MMVDPLLTKY		SVIMLDEAHE		RTLYTDIAIG		LLKKIQKKRG
DLRLIVASAT		LDADKFRDFF		NQNETSDPAR		DTCVILTVEG		RTFPVDIFYL
QSPVPDYIKS		TVETVVKIHQ		TEGDGDVLAF		LTGQEEVETV		VSMLIEQARA
LARTGMKRHL		RVLPMYAGLP		SFEQMKVFER		VSRSVRKVIV		ATNVAETSIT
ISGIVYVIDC		GFVKLRAYNP		RTAIECLVVV		PVSQASANQR		AGRGGRSRSG
KCYRLYTEEA		FDKLPQSTVP		EMQRSNLAPV		ILQLKALGID		NVLRFHFMSP
PPAQSMVQAL		ELLYALGGLD		KDCRLTEPLG		MRIAEFPLNP		MFAKMLLESG
NFGCSQEILS		IAAMMQIQNI		FVVPPNQKSH		AIRVHRKFAV		EEGDHLTMLN
IYEAFIKHNK		DSKWCQEHFL		NYKGLVRAAT		VREQLKKLLV		KFQVPRKSSE
GDPDLVLRCI		VSGFFANAAR		FHSTGAYRTI		RDDHELHIHP		ASVLYAEKPP
RWVIYNEVIQ		TSKYYMRDVT		AIESAWLLEL		APHFYQQGTH		LSLKAKRAKV
QDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 20