DNASE1L3

DNASE1L3
Ідентифікатори
Символи	DNASE1L3, DHP2, DNAS1L3, LSD, SLEB16, deoxyribonuclease I like 3, deoxyribonuclease 1 like 3
Зовнішні ІД	OMIM: 602244 MGI: 1314633 HomoloGene: 3630 GeneCards: DNASE1L3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • calcium ion binding • nuclease activity • endonuclease activity • endodeoxyribonuclease activity • hydrolase activity • deoxyribonuclease activity • deoxyribonuclease I activity Клітинна компонента • extracellular region • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро Біологічний процес • DNA metabolic process • DNA catabolic process • programmed cell death involved in cell development • GO:0097285 апоптоз • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • apoptotic DNA fragmentation • DNA catabolic process, endonucleolytic • neutrophil activation involved in immune response • regulation of acute inflammatory response • regulation of neutrophil mediated cytotoxicity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1776	13421
Ensembl	ENSG00000163687	ENSMUSG00000025279
UniProt	Q13609	O55070
RefSeq (мРНК)	NM_004944 NM_001256560	NM_007870
RefSeq (білок)	NP_001243489 NP_004935	NP_031896
Локус (UCSC)	Хр. 3: 58.19 – 58.21 Mb	Хр. 14: 14.48 – 14.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNASE1L3 (англ. Deoxyribonuclease 1 like 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 305 амінокислот, а молекулярна маса — 35 504.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSRELAPLLL		LLLSIHSALA		MRICSFNVRS		FGESKQEDKN		AMDVIVKVIK
RCDIILVMEI		KDSNNRICPI		LMEKLNRNSR		RGITYNYVIS		SRLGRNTYKE
QYAFLYKEKL		VSVKRSYHYH		DYQDGDADVF		SREPFVVWFQ		SPHTAVKDFV
IIPLHTTPET		SVKEIDELVE		VYTDVKHRWK		AENFIFMGDF		NAGCSYVPKK
AWKNIRLRTD		PRFVWLIGDQ		EDTTVKKSTN		CAYDRIVLRG		QEIVSSVVPK
SNSVFDFQKA		YKLTEEEALD		VSDHFPVEFK		LQSSRAFTNS		KKSVTLRKKT
KSKRS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у ядрі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

• Shiokawa D., Hirai M., Tanuma S. (1998). cDNA cloning of human DNase gamma: chromosomal localization of its gene and enzymatic properties of recombinant protein. Apoptosis. 3: 89—95. PMID 14646506 DOI:10.1023/A:1009692807692
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shiokawa D., Tanuma S. (2001). Characterization of human DNase I family endonucleases and activation of DNase gamma during apoptosis. Biochemistry. 40: 143—152. PMID 11141064 DOI:10.1021/bi001041a

Див. також

• Хромосома 3