DNMT3B

DNMT3B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QKJ, 3FLG, 5CIU
Ідентифікатори
Символи	DNMT3B, ICF, ICF1, M.HsaIIIB, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta, DNA methyltransferase 3 beta, FSHD4
Зовнішні ІД	OMIM: 602900 MGI: 1261819 HomoloGene: 56000 GeneCards: DNMT3B
Пов'язані генетичні захворювання
запальні захворювання кишківника, immunodeficiency-centromeric instability-facial anomalies syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • DNA-methyltransferase activity • chromatin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • histone deacetylase binding Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • Нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • response to ionizing radiation • C-5 methylation of cytosine • response to estradiol • response to hypoxia • cellular response to hyperoxia • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to activity • cellular response to dexamethasone stimulus • response to vitamin A • Метилювання ДНК • Метилювання • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression, epigenetic • positive regulation of histone H3-K4 methylation • positive regulation of neuron differentiation • negative regulation of histone H3-K9 methylation • регуляція експресії генів • response to caffeine • response to toxic substance • response to cocaine Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1789	13436
Ensembl	ENSG00000088305	ENSMUSG00000027478
UniProt	Q9UBC3	O88509
RefSeq (мРНК)	NM_001207055 NM_001207056 NM_006892 NM_175848 NM_175849 NM_175850	NM_001003960 NM_001003961 NM_001003963 NM_001122997 NM_001271744 NM_001271745 NM_001271746 NM_001271747 NM_010068
RefSeq (білок)	NP_001193984 NP_001193985 NP_008823 NP_787044 NP_787045 NP_787046	NP_001003960 NP_001003961 NP_001003963 NP_001116469 NP_001258673 NP_001258674 NP_001258675 NP_001258676 NP_034198
Локус (UCSC)	Хр. 20: 32.76 – 32.81 Mb	Хр. 2: 153.49 – 153.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DNMT3B (англ. DNA methyltransferase 3 beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 853 амінокислот, а молекулярна маса — 95 751.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKGDTRHLNG		EEDAGGREDS		ILVNGACSDQ		SSDSPPILEA		IRTPEIRGRR
SSSRLSKREV		SSLLSYTQDL		TGDGDGEDGD		GSDTPVMPKL		FRETRTRSES
PAVRTRNNNS		VSSRERHRPS		PRSTRGRQGR		NHVDESPVEF		PATRSLRRRA
TASAGTPWPS		PPSSYLTIDL		TDDTEDTHGT		PQSSSTPYAR		LAQDSQQGGM
ESPQVEADSG		DGDSSEYQDG		KEFGIGDLVW		GKIKGFSWWP		AMVVSWKATS
KRQAMSGMRW		VQWFGDGKFS		EVSADKLVAL		GLFSQHFNLA		TFNKLVSYRK
AMYHALEKAR		VRAGKTFPSS		PGDSLEDQLK		PMLEWAHGGF		KPTGIEGLKP
NNTQPVVNKS		KVRRAGSRKL		ESRKYENKTR		RRTADDSATS		DYCPAPKRLK
TNCYNNGKDR		GDEDQSREQM		ASDVANNKSS		LEDGCLSCGR		KNPVSFHPLF
EGGLCQTCRD		RFLELFYMYD		DDGYQSYCTV		CCEGRELLLC		SNTSCCRCFC
VECLEVLVGT		GTAAEAKLQE		PWSCYMCLPQ		RCHGVLRRRK		DWNVRLQAFF
TSDTGLEYEA		PKLYPAIPAA		RRRPIRVLSL		FDGIATGYLV		LKELGIKVGK
YVASEVCEES		IAVGTVKHEG		NIKYVNDVRN		ITKKNIEEWG		PFDLVIGGSP
CNDLSNVNPA		RKGLYEGTGR		LFFEFYHLLN		YSRPKEGDDR		PFFWMFENVV
AMKVGDKRDI		SRFLECNPVM		IDAIKVSAAH		RARYFWGNLP		GMNRPVIASK
NDKLELQDCL		EYNRIAKLKK		VQTITTKSNS		IKQGKNQLFP		VVMNGKEDVL
WCTELERIFG		FPVHYTDVSN		MGRGARQKLL		GRSWSVPVIR		HLFAPLKDYF
ACE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів, активаторів, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

• Kang E.S., Park C.W., Chung J.H. (2001). Dnmt3b, de novo DNA methyltransferase, interacts with SUMO-1 and Ubc9 through its N-terminal region and is subject to modification by SUMO-1. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289: 862—868. PMID 11735126 DOI:10.1006/bbrc.2001.6057
• Kim G.-D., Ni J., Kelesoglu N., Roberts R.J., Pradhan S. (2002). Co-operation and communication between the human maintenance and de novo DNA (cytosine-5) methyltransferases. EMBO J. 21: 4183—4195. PMID 12145218 DOI:10.1093/emboj/cdf401
• Okano M., Bell D.W., Haber D.A., Li E. (1999). DNA methyltransferases Dnmt3a and Dnmt3b are essential for de novo methylation and mammalian development. Cell. 99: 247—257. PMID 10555141 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81656-6

Див. також

• Хромосома 20