DTX2

DTX2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1V87
Ідентифікатори
Символи	DTX2, RNF58, deltex 2, E3 ubiquitin ligase, deltex E3 ubiquitin ligase 2
Зовнішні ІД	OMIM: 613141 MGI: 1921448 HomoloGene: 56904 GeneCards: DTX2
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	113878	74198
Ensembl	ENSG00000282379 ENSG00000091073	ENSMUSG00000004947
UniProt	Q86UW9	Q8R3P2
RefSeq (мРНК)	NM_001102594 NM_001102595 NM_001102596 NM_020892	NM_001256096 NM_001256097 NM_001256098 NM_023742
RefSeq (білок)	NP_001096064 NP_001096065 NP_001096066 NP_065943	NP_001243025 NP_001243026 NP_001243027 NP_076231
Локус (UCSC)	Хр. 7: 76.46 – 76.51 Mb	Хр. 5: 136.02 – 136.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DTX2 (англ. Deltex E3 ubiquitin ligase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 622 амінокислот, а молекулярна маса — 67 246.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMAPSPSLV		QVYTSPAAVA		VWEWQDGLGT		WHPYSATVCS		FIEQQFVQQK
GQRFGLGSLA		HSIPLGQADP		SLAPYIIDLP		SWTQFRQDTG		TMRAVRRHLF
PQHSAPGRGV		VWEWLSDDGS		WTAYEASVCD		YLEQQVARGN		QLVDLAPLGY
NYTVNYTTHT		QTNKTSSFCR		SVRRQAGPPY		PVTTIIAPPG		HTGVACSCHQ
CLSGSRTGPV		SGRYRHSMTN		LPAYPVPQHP		PHRTASVFGT		HQAFAPYNKP
SLSGARSAPR		LNTTNAWGAA		PPSLGSQPLY		RSSLSHLGPQ		HLPPGSSTSG
AVSASLPSGP		SSSPGSVPAT		VPMQMPKPSR		VQQALAGMTS		VLMSAIGLPV
CLSRAPQPTS		PPASRLASKS		HGSVKRLRKM		SVKGATPKPE		PEPEQVIKNY
TEELKVPPDE		DCIICMEKLS		TASGYSDVTD		SKAIGSLAVG		HLTKCSHAFH
LLCLLAMYCN		GNKDGSLQCP		SCKTIYGEKT		GTQPQGKMEV		LRFQMSLPGH
EDCGTILIVY		SIPHGIQGPE		HPNPGKPFTA		RGFPRQCYLP		DNAQGRKVLE
LLKVAWKRRL		IFTVGTSSTT		GETDTVVWNE		IHHKTEMDRN		ITGHGYPDPN
YLQNVLAELA		AQGVTEDCLE		QQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yi Z., Yi T., Wu Z. (2006). cDNA cloning, characterization and expression analysis of DTX2, a human WWE and RING-finger gene, in human embryos. DNA Seq. 17: 175—180.

Див. також

• Хромосома 7