DTX3L

DTX3L
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3PG6
Ідентифікатори
Символи	DTX3L, BBAP, deltex 3 like, E3 ubiquitin ligase, deltex E3 ubiquitin ligase 3L, RNF143
Зовнішні ІД	OMIM: 613143 MGI: 2656973 HomoloGene: 51375 GeneCards: DTX3L
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity • GO:0048551 enzyme inhibitor activity • GO:0010577 enzyme activator activity • enzyme binding • GO:0031493 histone binding • ubiquitin-like protein ligase binding • STAT family protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • early endosome • лізосома • lysosomal membrane • ендосома • мембрана • early endosome membrane • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • histone monoubiquitination • double-strand break repair • GO:0100026 Репарація ДНК • Убіквітин-залежний протеоліз • cellular response to DNA damage stimulus • protein polyubiquitination • positive regulation of defense response to virus by host • endosome to lysosome transport • positive regulation of protein binding • histone H2A ubiquitination • histone H2B ubiquitination • positive regulation of chromatin binding • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity • protein autoubiquitination • protein K48-linked ubiquitination • positive regulation of protein localization to nucleus • positive regulation of NAD+ ADP-ribosyltransferase activity • positive regulation of protein localization to early endosome • positive regulation of receptor catabolic process • positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining • процес імунної системи • protein transport • вроджений імунітет • defense response to virus • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Сигнальний шлях Notch Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	151636	209200
Ensembl	ENSG00000163840	ENSMUSG00000049502
UniProt	Q8TDB6	Q3UIR3
RefSeq (мРНК)	NM_138287	NM_001013371
RefSeq (білок)	NP_612144	NP_001013389
Локус (UCSC)	Хр. 3: 122.56 – 122.58 Mb	Хр. 16: 35.75 – 35.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DTX3L (англ. Deltex E3 ubiquitin ligase 3L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 83 554.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASHLRPPSP		LLVRVYKSGP		RVRRKLESYF		QSSKSSGGGE		CTVSTQEHEA
PGTFRVEFSE		RAAKERVLKK		GEHQILVDEK		PVPIFLVPTE		NSIKKNTRPQ
ISSLTQSQAE		TPSGDMHQHE		GHIPNAVDSC		LQKIFLTVTA		DLNCNLFSKE
QRAYITTLCP		SIRKMEGHDG		IEKVCGDFQD		IERIHQFLSE		QFLESEQKQQ
FSPSMTERKP		LSQQERDSCI		SPSEPETKAE		QKSNYFEVPL		PYFEYFKYIC
PDKINSIEKR		FGVNIEIQES		SPNMVCLDFT		SSRSGDLEAA		RESFASEFQK
NTEPLKQECV		SLADSKQANK		FKQELNHQFT		KLLIKEKGGE		LTLLGTQDDI
SAAKQKISEA		FVKIPVKLFA		ANYMMNVIEV		DSAHYKLLET		ELLQEISEIE
KRYDICSKVS		EKGQKTCILF		ESKDRQVDLS		VHAYASFIDA		FQHASCQLMR
EVLLLKSLGK		ERKHLHQTKF		ADDFRKRHPN		VHFVLNQESM		TLTGLPNHLA
KAKQYVLKGG		GMSSLAGKKL		KEGHETPMDI		DSDDSKAASP		PLKGSVSSEA
SELDKKEKGI		CVICMDTISN		KKVLPKCKHE		FCAPCINKAM		SYKPICPTCQ
TSYGIQKGNQ		PEGSMVFTVS		RDSLPGYESF		GTIVITYSMK		AGIQTEEHPN
PGKRYPGIQR		TAYLPDNKEG		RKVLKLLYRA		FDQKLIFTVG		YSRVLGVSDV
ITWNDIHHKT		SRFGGPEMYG		YPDPSYLKRV		KEELKAKGIE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Obiero J., Walker J.R., Dhe-Paganon S. (2012). Fold of the conserved DTC domain in deltex proteins. Proteins. 80: 1495—1499. PMID 22411408 DOI:10.1002/prot.24054

Див. також

• Хромосома 3