EFCAB6

EFCAB6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1WLZ, 5D67
Ідентифікатори
Символи	EFCAB6, DJBP, HSCBCIP1, dJ185D5.1, EF-hand calcium binding domain 6
Зовнішні ІД	MGI: 1924877 HomoloGene: 11259 GeneCards: EFCAB6
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • calcium ion binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64800	77627
Ensembl	ENSG00000186976	ENSMUSG00000022441
UniProt	Q5THR3	Q6P1E8
RefSeq (мРНК)	NM_022785 NM_198856	NM_001161628 NM_001161629 NM_029946
RefSeq (білок)	NP_073622 NP_942153	NP_001155100 NP_001155101 NP_084222
Локус (UCSC)	Хр. 22: 43.53 – 43.81 Mb	Хр. 15: 83.75 – 83.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EFCAB6 (англ. EF-hand calcium binding domain 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 501 амінокислот, а молекулярна маса — 172 930.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCKMAIIPDW		LRSHPHTRKF		THSRPHSSPC		RVYSRNGSPN		KFRSSSTTAV
ANPTLSSLDV		KRILFQKITD		RGDELQKAFQ		LLDTGQNLTV		SKSELRRIIT
DFLMPLTREQ		FQDVLAQIPL		STSGTVPYLA		FLSRFGGIDL		YINGIKRGGG
NEMNCCRTLR		ELEIQVGEKV		FKNIKTVMKA		FELIDVNKTG		LVRPQELRRV
LETFCMKLRD		EEYEKFSKHY		NIHKDTAVDY		NVFLKNLSIN		NDLNLRYCMG
NQEVSLENQQ		AKNSKKERLL		GSASSEDIWR		NYSLDEIERN		FCLQLSKSYE
KVEKALSAGD		PCKGGYVSFN		YLKIVLDTFV		YQIPRRIFIQ		LMKRFGLKAT
TKINWKQFLT		SFHEPQGLQV		SSKGPLTKRN		SINSRNESHK		ENIITKLFRH
TEDHSASLKK		ALLIINTKPD		GPITREEFRY		ILNCMAVKLS		DSEFKELMQM
LDPGDTGVVN		TSMFIDLIEE		NCRMRKTSPC		TDAKTPFLLA		WDSVEEIVHD
TITRNLQAFY		NMLRSYDLGD		TGRIGRNNFK		KIMHVFCPFL		TNAHFIKLCS
KIQDIGSGRI		LYKKLLACIG		IDGPPTVSPV		LVPKDQLLSE		HLQKDEQQQP
DLSERTKLTE		DKTTLTKKMT		TEEVIEKFKK		CIQQQDPAFK		KRFLDFSKEP
NGKINVHDFK		KVLEDTGMPM		DDDQYALLTT		KIGFEKEGMS		YLDFAAGFED
PPMRGPETTP		PQPPTPSKSY		VNSHFITAEE		CLKLFPRRLK		ESFRDPYSAF
FKTDADRDGI		INMHDLHRLL		LHLLLNLKDD		EFERFLGLLG		LRLSVTLNFR
EFQNLCEKRP		WRTDEAPQRL		IRPKQKVADS		ELACEQAHQY		LVTKAKNRWS
DLSKNFLETD		NEGNGILRRR		DIKNALYGFD		IPLTPREFEK		LWARYDTEGK
GHITYQEFLQ		KLGINYSPAV		HRPCAEDYFN		FMGHFTKPQQ		LQEEMKELQQ
STEKAVAARD		KLMDRHQDIS		KAFTKTDQSK		TNYISICKMQ		EVLEECGCSL
TEGELTHLLN		SWGVSRHDNA		INYLDFLRAV		ENSKSTGAQP		KEKEESMPIN
FATLNPQEAV		RKIQEVVESS		QLALSTAFSA		LDKEDTGFVK		ATEFGQVLKD
FCYKLTDNQY		HYFLRKLRIH		LTPYINWKYF		LQNFSCFLEE		TADEWAEKMP
KGPPPTSPKA		TADRDILARL		HKAVTSHYHA		ITQEFENFDT		MKTNTISREE
FRAICNRRVQ		ILTDEQFDRL		WNEMPVNAKG		RLKYPDFLSR		FSSETAATPM
ATGDSAVAQR		GSSVPDVSEG		TRSALSLPTQ		ELRPGSKSQS		HPCTPASTTV
IPGTPPLQNC		DPIESRLRKR		IQGCWRQLLK		ECKEKDVARQ		GDINASDFLA
LVEKFNLDIS		KEECQQLIIK		YDLKSNGKFA		YCDFIQSCVL		LLKAKESSLM
HRMKIQNAHK		MKEAGAETPS		FYSALLRIQP		KIVHCWRPMR		RTFKSYDEAG
TGLLSVADFR		TVLRQYSINL		SEEEFFHILE		YYDKTLSSKI		SYNDFLRAFL
Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hirosawa M., Nagase T., Murahashi Y., Kikuno R., Ohara O. (2001). Identification of novel transcribed sequences on human chromosome 22 by expressed sequence tag mapping. DNA Res. 8: 1—9. PMID 11258795 DOI:10.1093/dnares/8.1.1
• Niki T., Takahashi-Niki K., Taira T., Iguchi-Ariga S.M.M., Ariga H. (2003). DJBP: a novel DJ-1-binding protein, negatively regulates the androgen receptor by recruiting histone deacetylase complex, and DJ-1 antagonizes this inhibition by abrogation of this complex. Mol. Cancer Res. 1: 247—261. PMID 12612053

Див. також

• Хромосома 22