EIF4A1

EIF4A1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2G9N, 2ZU6, 3EIQ
Ідентифікатори
Символи	EIF4A1, DDX2A, EIF-4A, EIF4A, eIF-4A-I, eIF4A-I, eukaryotic translation initiation factor 4A1
Зовнішні ІД	OMIM: 602641 MGI: 95303 HomoloGene: 103998 GeneCards: EIF4A1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • translation initiation factor activity • translation factor activity, RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA cap binding • double-stranded RNA binding • hydrolase activity • ATP binding • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • eukaryotic translation initiation factor 4F complex • екзосома • клітинне ядро • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • RNA secondary structure unwinding • translational initiation • регуляція експресії генів • GO:0022415 viral process • Біосинтез білків Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1973	13681
Ensembl	ENSG00000161960	ENSMUSG00000059796
UniProt	P60842	P60843
RefSeq (мРНК)	NM_001416 NM_001204510	NM_001159375 NM_144958
RefSeq (білок)	NP_001191439 NP_001407	NP_001152847 NP_659207
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.57 – 7.58 Mb	Хр. 11: 69.56 – 69.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EIF4A1 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 406 амінокислот, а молекулярна маса — 46 154.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSASQDSRSR		DNGPDGMEPE		GVIESNWNEI		VDSFDDMNLS		ESLLRGIYAY
GFEKPSAIQQ		RAILPCIKGY		DVIAQAQSGT		GKTATFAISI		LQQIELDLKA
TQALVLAPTR		ELAQQIQKVV		MALGDYMGAS		CHACIGGTNV		RAEVQKLQME
APHIIVGTPG		RVFDMLNRRY		LSPKYIKMFV		LDEADEMLSR		GFKDQIYDIF
QKLNSNTQVV		LLSATMPSDV		LEVTKKFMRD		PIRILVKKEE		LTLEGIRQFY
INVEREEWKL		DTLCDLYETL		TITQAVIFIN		TRRKVDWLTE		KMHARDFTVS
AMHGDMDQKE		RDVIMREFRS		GSSRVLITTD		LLARGIDVQQ		VSLVINYDLP
TNRENYIHRI		GRGGRFGRKG		VAINMVTEED		KRTLRDIETF		YNTSIEEMPL
NVADLI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.

Література

• Kim N.-S., Kato T., Abe N., Kato S. (1993). Nucleotide sequence of human cDNA encoding eukaryotic initiation factor 4AI. Nucleic Acids Res. 21: 2012—2012. PMID 8493113 DOI:10.1093/nar/21.8.2012
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Craig A.W.B., Haghighat A., Yu A.T.K., Sonenberg N. (1998). Interaction of polyadenylate-binding protein with the eIF4G homologue PAIP enhances translation. Nature. 392: 520—523. PMID 9548260 DOI:10.1038/33198
• Mendell J.T., Medghalchi S.M., Lake R.G., Noensie E.N., Dietz H.C. (2000). Novel Upf2p orthologues suggest a functional link between translation initiation and nonsense surveillance complexes. Mol. Cell. Biol. 20: 8944—8957. PMID 11073994 DOI:10.1128/MCB.20.23.8944-8957.2000
• Li W., Belsham G.J., Proud C.G. (2001). Eukaryotic initiation factors 4A (eIF4A) and 4G (eIF4G) mutually interact in a 1:1 ratio in vivo. J. Biol. Chem. 276: 29111—29115. PMID 11408474 DOI:10.1074/jbc.C100284200
• Mingot J.-M., Bohnsack M.T., Jaekle U., Goerlich D. (2004). Exportin 7 defines a novel general nuclear export pathway. EMBO J. 23: 3227—3236. PMID 15282546 DOI:10.1038/sj.emboj.7600338

Див. також

• Хромосома 17