ELAC1

ELAC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZWF
Ідентифікатори
Символи	ELAC1, D29, elaC ribonuclease Z 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608079 MGI: 1890495 HomoloGene: 10272 GeneCards: ELAC1
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • endonuclease activity • 3'-tRNA processing endoribonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • tRNA 3'-trailer cleavage • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • tRNA processing • tRNA 3'-trailer cleavage, endonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55520	114615
Ensembl	ENSG00000141642	ENSMUSG00000036941
UniProt	Q9H777	Q8VEB6
RefSeq (мРНК)	NM_018696	NM_053255
RefSeq (білок)	NP_061166	NP_444485
Локус (UCSC)	Хр. 18: 50.97 – 50.99 Mb	Хр. 18: 73.87 – 73.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ELAC1 (англ. ElaC ribonuclease Z 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 363 амінокислот, а молекулярна маса — 40 019.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSMDVTFLGT		GAAYPSPTRG		ASAVVLRCEG		ECWLFDCGEG		TQTQLMKSQL
KAGRITKIFI		THLHGDHFFG		LPGLLCTISL		QSGSMVSKQP		IEIYGPVGLR
DFIWRTMELS		HTELVFHYVV		HELVPTADQC		PAEELKEFAH		VNRADSPPKE
EQGRTILLDS		EENSYLLFDD		EQFVVKAFRL		FHRIPSFGFS		VVEKKRPGKL
NAQKLKDLGV		PPGPAYGKLK		NGISVVLENG		VTISPQDVLK		KPIVGRKICI
LGDCSGVVGD		GGVKLCFEAD		LLIHEATLDD		AQMDKAKEHG		HSTPQMAATF
AKLCRAKRLV		LTHFSQRYKP		VALAREGETD		GIAELKKQAE		SVLDLQEVTL
AEDFMVISIP		IKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг тРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takaku H., Minagawa A., Takagi M., Nashimoto M. (2003). A candidate prostate cancer susceptibility gene encodes tRNA 3' processing endoribonuclease. Nucleic Acids Res. 31: 2272—2278. PMID 12711671 DOI:10.1093/nar/gkg337
• Brzezniak L.K., Bijata M., Szczesny R.J., Stepien P.P. (2011). Involvement of human ELAC2 gene product in 3' end processing of mitochondrial tRNAs. RNA Biol. 8: 616—626. PMID 21593607 DOI:10.4161/rna.8.4.15393

Див. також

• Хромосома 18