ERBIN

ERBIN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MFG, 1MFL, 1N7T, 2H3L, 2QBW, 3CH8
Ідентифікатори
Символи	ERBIN, HEL-S-78, LAP2, ERBB2IP, erbb2 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 606944 MGI: 1890169 HomoloGene: 41282 GeneCards: ERBIN
Онтологія гена Молекулярна функція • structural constituent of cytoskeleton • ErbB-2 class receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • Ядерна мембрана • мембрана • клітинна мембрана • hemidesmosome • Базальна мембрана • Міжклітинні контакти • basal plasma membrane • basolateral plasma membrane • клітинне ядро • nuclear speck • neuromuscular junction • postsynapse • glutamatergic synapse • postsynaptic specialization Біологічний процес • negative regulation of monocyte chemotactic protein-1 production • сортування білків • epidermal growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • cellular response to tumor necrosis factor • response to muramyl dipeptide • basal protein localization • cell growth • response to lipopolysaccharide • адгезія клітин • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity • intermediate filament cytoskeleton organization • integrin-mediated signaling pathway • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • ERBB2 signaling pathway • regulation of postsynaptic membrane neurotransmitter receptor levels Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55914	59079
Ensembl	ENSG00000112851	ENSMUSG00000021709
UniProt	Q96RT1	Q80TH2
RefSeq (мРНК)	NM_001006600 NM_001253697 NM_001253698 NM_001253699 NM_001253701 NM_018695	NM_001005868 NM_021563 NM_001289473 NM_001289474 NM_001289475
RefSeq (білок)	NP_001006600 NP_001240626 NP_001240627 NP_001240628 NP_001240630 NP_061165	NP_001005868 NP_001276402 NP_001276403 NP_001276404
Локус (UCSC)	Хр. 5: 65.93 – 66.08 Mb	Хр. 13: 103.96 – 104.06 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ERBIN (англ. Erbb2 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 412 амінокислот, а молекулярна маса — 158 298.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTTKRSLFVR		LVPCRCLRGE		EETVTTLDYS		HCSLEQVPKE		IFTFEKTLEE
LYLDANQIEE		LPKQLFNCQS		LHKLSLPDND		LTTLPASIAN		LINLRELDVS
KNGIQEFPEN		IKNCKVLTIV		EASVNPISKL		PDGFSQLLNL		TQLYLNDAFL
EFLPANFGRL		TKLQILELRE		NQLKMLPKTM		NRLTQLERLD		LGSNEFTEVP
EVLEQLSGLK		EFWMDANRLT		FIPGFIGSLK		QLTYLDVSKN		NIEMVEEGIS
TCENLQDLLL		SSNSLQQLPE		TIGSLKNITT		LKIDENQLMY		LPDSIGGLIS
VEELDCSFNE		VEALPSSIGQ		LTNLRTFAAD		HNYLQQLPPE		IGSWKNITVL
FLHSNKLETL		PEEMGDMQKL		KVINLSDNRL		KNLPFSFTKL		QQLTAMWLSD
NQSKPLIPLQ		KETDSETQKM		VLTNYMFPQQ		PRTEDVMFIS		DNESFNPSLW
EEQRKQRAQV		AFECDEDKDE		REAPPREGNL		KRYPTPYPDE		LKNMVKTVQT
IVHRLKDEET		NEDSGRDLKP		HEDQQDINKD		VGVKTSESTT		TVKSKVDERE
KYMIGNSVQK		ISEPEAEISP		GSLPVTANMK		ASENLKHIVN		HDDVFEESEE
LSSDEEMKMA		EMRPPLIETS		INQPKVVALS		NNKKDDTKET		DSLSDEVTHN
SNQNNSNCSS		PSRMSDSVSL		NTDSSQDTSL		CSPVKQTHID		INSKIRQEDE
NFNSLLQNGD		ILNSSTEEKF		KAHDKKDFNL		PEYDLNVEER		LVLIEKSVDS
TATADDTHKL		DHINMNLNKL		ITNDTFQPEI		MERSKTQDIV		LGTSFLSINS
KEETEHLENG		NKYPNLESVN		KVNGHSEETS		QSPNRTEPHD		SDCSVDLGIS
KSTEDLSPQK		SGPVGSVVKS		HSITNMEIGG		LKIYDILSDN		GPQQPSTTVK
ITSAVDGKNI		VRSKSATLLY		DQPLQVFTGS		SSSSDLISGT		KAIFKFDSNH
NPEEPNIIRG		PTSGPQSAPQ		IYGPPQYNIQ		YSSSAAVKDT		LWHSKQNPQI
DHASFPPQLL		PRSESTENQS		YAKHSANMNF		SNHNNVRANT		AYHLHQRLGP
ARHGEMWAIS		PNDRLIPAVT		RSTIQRQSSV		SSTASVNLGD		PGSTRRAQIP
EGDYLSYREF		HSAGRTPPMM		PGSQRPLSAR		TYSIDGPNAS		RPQSARPSIN
EIPERTMSVS		DFNYSRTSPS		KRPNARVGSE		HSLLDPPGKS		KVPRDWREQV
LRHIEAKKLE		KKHPQTSSSG		DPCQDGIFIS		GQQNYSSATL		SHKDVPPDSL
MKMPLSNGQM		GQPLRPQANY		SQIHHPPQAS		VARHPSREQL		IDYLMLKVAH
QPPYTQPHCS		PRQGHELAKQ		EIRVRVEKDP		ELGFSISGGV		GGRGNPFRPD
DDGIFVTRVQ		PEGPASKLLQ		PGDKIIQANG		YSFINIEHGQ		AVSLLKTFQN
TVELIIVREV		SS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Birrane G., Chung J., Ladias J.A. (2003). Novel mode of ligand recognition by the Erbin PDZ domain. J. Biol. Chem. 278: 1399—1402. PMID 12444095 DOI:10.1074/jbc.C200571200

Див. також

• Хромосома 5