EXOSC10

EXOSC10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CPR, 3SAF, 3SAG, 3SAH
Ідентифікатори
Символи	EXOSC10, PM-Scl, PM/Scl-100, PMSCL, PMSCL2, RRP6, Rrp6p, p2, p3, p4, exosome component 10
Зовнішні ІД	OMIM: 605960 MGI: 1355322 HomoloGene: 31105 GeneCards: EXOSC10
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • каталітична активність • 3'-5' exonuclease activity • nucleic acid binding • nuclease activity • exonuclease activity • hydrolase activity • RNA binding • 3'-5'-exoribonuclease activity • telomerase RNA binding • single-stranded RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Екзосома • мембрана • nuclear exosome (RNase complex) • внутрішньоклітинний • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • CUT catabolic process • nuclear-transcribed mRNA catabolic process • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • cell metabolism • maturation of 5.8S rRNA • histone mRNA catabolic process • dosage compensation by inactivation of X chromosome • nucleobase-containing compound metabolic process • rRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • negative regulation of telomere maintenance via telomerase • regulation of telomerase RNA localization to Cajal body • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • nuclear polyadenylation-dependent snoRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent snRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent CUT catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent antisense transcript catabolic process • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5394	50912
Ensembl	ENSG00000171824	ENSMUSG00000017264
UniProt	Q01780	P56960
RefSeq (мРНК)	NM_001001998 NM_002685	NM_016699 NM_001355489 NM_001355490
RefSeq (білок)	NP_001001998 NP_002676	NP_057908 NP_001342418 NP_001342419
Локус (UCSC)	Хр. 1: 11.07 – 11.1 Mb	Хр. 4: 148.64 – 148.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXOSC10 (англ. Exosome component 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 885 амінокислот, а молекулярна маса — 100 831.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPPSTREPR		VLSATSATKS		DGEMVLPGFP		DADSFVKFAL		GSVVAVTKAS
GGLPQFGDEY		DFYRSFPGFQ		AFCETQGDRL		LQCMSRVMQY		HGCRSNIKDR
SKVTELEDKF		DLLVDANDVI		LERVGILLDE		ASGVNKNQQP		VLPAGLQVPK
TVVSSWNRKA		AEYGKKAKSE		TFRLLHAKNI		IRPQLKFREK		IDNSNTPFLP
KIFIKPNAQK		PLPQALSKER		RERPQDRPED		LDVPPALADF		IHQQRTQQVE
QDMFAHPYQY		ELNHFTPADA		VLQKPQPQLY		RPIEETPCHF		ISSLDELVEL
NEKLLNCQEF		AVDLEHHSYR		SFLGLTCLMQ		ISTRTEDFII		DTLELRSDMY
ILNESLTDPA		IVKVFHGADS		DIEWLQKDFG		LYVVNMFDTH		QAARLLNLGR
HSLDHLLKLY		CNVDSNKQYQ		LADWRIRPLP		EEMLSYARDD		THYLLYIYDK
MRLEMWERGN		GQPVQLQVVW		QRSRDICLKK		FIKPIFTDES		YLELYRKQKK
HLNTQQLTAF		QLLFAWRDKT		ARREDESYGY		VLPNHMMLKI		AEELPKEPQG
IIACCNPVPP		LVRQQINEMH		LLIQQAREMP		LLKSEVAAGV		KKSGPLPSAE
RLENVLFGPH		DCSHAPPDGY		PIIPTSGSVP		VQKQASLFPD		EKEDNLLGTT
CLIATAVITL		FNEPSAEDSK		KGPLTVAQKK		AQNIMESFEN		PFRMFLPSLG
HRAPVSQAAK		FDPSTKIYEI		SNRWKLAQVQ		VQKDSKEAVK		KKAAEQTAAR
EQAKEACKAA		AEQAISVRQQ		VVLENAAKKR		ERATSDPRTT		EQKQEKKRLK
ISKKPKDPEP		PEKEFTPYDY		SQSDFKAFAG		NSKSKVSSQF		DPNKQTPSGK
KCIAAKKIKQ		SVGNKSMSFP		TGKSDRGFRY		NWPQR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, екзонуклеаз, нуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• Bluethner M., Bautz F.A. (1992). Cloning and characterization of the cDNA coding for a polymyositis-scleroderma overlap syndrome-related nucleolar 100-kD protein. J. Exp. Med. 176: 973—980. PMID 1383382 DOI:10.1084/jem.176.4.973
• Ge Q., Frank M.B., O'Brien C., Targoff I.N. (1992). Cloning of a complementary DNA coding for the 100-kD antigenic protein of the PM-Scl autoantigen. J. Clin. Invest. 90: 559—570. PMID 1644924 DOI:10.1172/JCI115895
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lejeune F., Li X., Maquat L.E. (2003). Nonsense-mediated mRNA decay in mammalian cells involves decapping, deadenylating, and exonucleolytic activities. Mol. Cell. 12: 675—687. PMID 14527413 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00349-6
• Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004
• West S., Gromak N., Norbury C.J., Proudfoot N.J. (2006). Adenylation and exosome-mediated degradation of cotranscriptionally cleaved pre-messenger RNA in human cells. Mol. Cell. 21: 437—443. PMID 16455498 DOI:10.1016/j.molcel.2005.12.008

Див. також

• Хромосома 1