EXOSC7

EXOSC7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC7, EAP1, RRP42, Rrp42p, hRrp42p, p8, Exosome component 7
Зовнішні ІД	OMIM: 606488 MGI: 1913696 HomoloGene: 8994 GeneCards: EXOSC7
Онтологія гена Молекулярна функція • 3'-5'-exoribonuclease activity • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Екзосома • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear exosome (RNase complex) • cytoplasmic exosome (RNase complex) Біологічний процес • regulation of mRNA stability • Деградація РНК • rRNA processing • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • U1 snRNA 3'-end processing • U4 snRNA 3'-end processing • U5 snRNA 3'-end processing • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process • rRNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23016	66446
Ensembl	ENSG00000075914	ENSMUSG00000025785
UniProt	Q15024	Q9D0M0
RefSeq (мРНК)	NM_015004	NM_001081188 NM_025568
RefSeq (білок)	NP_055819	NP_001074657
Локус (UCSC)	Хр. 3: 44.98 – 45.04 Mb	Хр. 9: 122.94 – 122.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXOSC7 (англ. Exosome component 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 31 821.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASVTLSEAE		KVYIVHGVQE		DLRVDGRGCE		DYRCVEVETD		VVSNTSGSAR
VKLGHTDILV		GVKAEMGTPK		LEKPNEGYLE		FFVDCSASAT		PEFEGRGGDD
LGTEIANTLY		RIFNNKSSVD		LKTLCISPRE		HCWVLYVDVL		LLECGGNLFD
AISIAVKAAL		FNTRIPRVRV		LEDEEGSKDI		ELSDDPYDCI		RLSVENVPCI
VTLCKIGYRH		VVDATLQEEA		CSLASLLVSV		TSKGVVTCMR		KVGKGSLDPE
SIFEMMETGK		RVGKVLHASL		QSVVHKEESL		GPKRQKVGFL		G

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг рРНК, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Raijmakers R., Vree Egberts W., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions between human exosome components support the assembly of RNase PH-type subunits into a six-membered PNPase-like ring. J. Mol. Biol. 323: 653—663. PMID 12419256 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00947-6
• Raijmakers R., Noordman Y.E., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions of hCsl4p with other human exosome subunits. J. Mol. Biol. 315: 809—818. PMID 11812149 DOI:10.1006/jmbi.2001.5265
• Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 3