EXOSC8

EXOSC8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC8, CIP3, EAP2, OIP2, RRP43, Rrp43p, bA421P11.3, p9, PCH1C, Exosome component 8
Зовнішні ІД	OMIM: 606019 MGI: 1916889 HomoloGene: 12323 GeneCards: EXOSC8
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • identical protein binding • mRNA 3'-UTR AU-rich region binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Екзосома • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear exosome (RNase complex) • cytoplasmic exosome (RNase complex) Біологічний процес • regulation of mRNA stability • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • Деградація РНК • rRNA processing • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • U1 snRNA 3'-end processing • U4 snRNA 3'-end processing • U5 snRNA 3'-end processing • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent mRNA catabolic process • GO:0022610 життєдіяльність • rRNA catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11340	69639
Ensembl	ENSG00000120699	ENSMUSG00000027752
UniProt	Q96B26	Q9D753
RefSeq (мРНК)	NM_181503	NM_001163570 NM_027148
RefSeq (білок)	NP_852480	NP_001157042 NP_081424
Локус (UCSC)	Хр. 13: 37 – 37.03 Mb	Хр. 3: 54.64 – 54.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXOSC8 (англ. Exosome component 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 276 амінокислот, а молекулярна маса — 30 040.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGFKTVEP		LEYYRRFLKE		NCRPDGRELG		EFRTTTVNIG		SISTADGSAL
VKLGNTTVIC		GVKAEFAAPS		TDAPDKGYVV		PNVDLPPLCS		SRFRSGPPGE
EAQVASQFIA		DVIENSQIIQ		KEDLCISPGK		LVWVLYCDLI		CLDYDGNILD
ACTFALLAAL		KNVQLPEVTI		NEETALAEVN		LKKKSYLNIR		THPVATSFAV
FDDTLLIVDP		TGEEEHLATG		TLTIVMDEEG		KLCCLHKPGG		SGLTGAKLQD
CMSRAVTRHK		EVKKLMDEVI		KSMKPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесмнг рРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Williams J.M., Chen G.-C., Zhu L., Rest R.F. (1998). Using the yeast two-hybrid system to identify human epithelial cell proteins that bind gonococcal Opa proteins: intracellular gonococci bind pyruvate kinase via their Opa proteins and require host pyruvate for growth. Mol. Microbiol. 27: 171—186. PMID 9466265 DOI:10.1046/j.1365-2958.1998.00670.x
• Raijmakers R., Vree Egberts W., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions between human exosome components support the assembly of RNase PH-type subunits into a six-membered PNPase-like ring. J. Mol. Biol. 323: 653—663. PMID 12419256 DOI:10.1016/S0022-2836(02)00947-6
• Lehner B., Sanderson C.M. (2004). A protein interaction framework for human mRNA degradation. Genome Res. 14: 1315—1323. PMID 15231747 DOI:10.1101/gr.2122004
• van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037

Див. також

• Хромосома 13