FANCF

FANCF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IQC
Ідентифікатори
Символи	FANCF, FAF, Fanconi anemia complementation group F, FA complementation group F
Зовнішні ІД	OMIM: 613897 MGI: 3689889 HomoloGene: 75185 GeneCards: FANCF
Пов'язані генетичні захворювання
Fanconi anemia complementation group F
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • Fanconi anaemia nuclear complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • interstrand cross-link repair • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0022610 життєдіяльність • ovarian follicle development • Сперматогенез • Убіквітин-залежний протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2188	100040608
Ensembl	ENSG00000183161	ENSMUSG00000092118
UniProt	Q9NPI8	E9Q5Z5
RefSeq (мРНК)	NM_022725	NM_001115087
RefSeq (білок)	NP_073562	NP_001108559
Локус (UCSC)	Хр. 11: 22.62 – 22.63 Mb	Хр. 7: 51.51 – 51.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FANCF (англ. Fanconi anemia complementation group F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 374 амінокислот, а молекулярна маса — 42 254.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESLLQHLDR		FSELLAVSST		TYVSTWDPAT		VRRALQWARY		LRHIHRRFGR
HGPIRTALER		RLHNQWRQEG		GFGRGPVPGL		ANFQALGHCD		VLLSLRLLEN
RALGDAARYH		LVQQLFPGPG		VRDADEETLQ		ESLARLARRR		SAVHMLRFNG
YRENPNLQED		SLMKTQAELL		LERLQEVGKA		EAERPARFLS		SLWERLPQNN
FLKVIAVALL		QPPLSRRPQE		ELEPGIHKSP		GEGSQVLVHW		LLGNSEVFAA
FCRALPAGLL		TLVTSRHPAL		SPVYLGLLTD		WGQRLHYDLQ		KGIWVGTESQ
DVPWEELHNR		FQSLCQAPPP		LKDKVLTALE		TCKAQDGDFE		VPGLSIWTDL
LLALRSGAFR		KRQVLGLSAG		LSSV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kowal P., Gurtan A.M., Stuckert P., D'Andrea A.D., Ellenberger T. (2007). Structural determinants of human FANCF protein that function in the assembly of a DNA damage signaling complex. J. Biol. Chem. 282: 2047—2055. PMID 17082180 DOI:10.1074/jbc.M608356200

Див. також

• Хромосома 11