FCN1

FCN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2D39, 2JHH, 2JHI, 2JHK, 2JHL, 2JHM, 2WNP
Ідентифікатори
Символи	FCN1, FCNM, ficolin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601252 MGI: 1341158 HomoloGene: 1518 GeneCards: FCN1
Онтологія гена Молекулярна функція • sialic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor binding • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • GO:0008329 pattern recognition receptor activity • serine-type endopeptidase activity • carbohydrate derivative binding Клітинна компонента • extracellular region • клітинна мембрана • колаген • extrinsic component of external side of plasma membrane • мембрана • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • complement activation, lectin pathway • complement activation • G protein-coupled receptor signaling pathway • recognition of apoptotic cell • protein localization to cell surface • cell surface pattern recognition receptor signaling pathway • процес імунної системи • протеоліз • вроджений імунітет • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2219	14134
Ensembl	ENSG00000085265	ENSMUSG00000026835
UniProt	O00602	O70497
RefSeq (мРНК)	NM_002003	NM_010190
RefSeq (білок)	NP_001994	NP_034320
Локус (UCSC)	Хр. 9: 134.9 – 134.92 Mb	Хр. 2: 27.97 – 27.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FCN1 (англ. Ficolin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 35 078.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELSGATMAR		GLAVLLVLFL		HIKNLPAQAA		DTCPEVKVVG		LEGSDKLTIL
RGCPGLPGAP		GPKGEAGVIG		ERGERGLPGA		PGKAGPVGPK		GDRGEKGMRG
EKGDAGQSQS		CATGPRNCKD		LLDRGYFLSG		WHTIYLPDCR		PLTVLCDMDT
DGGGWTVFQR		RMDGSVDFYR		DWAAYKQGFG		SQLGEFWLGN		DNIHALTAQG
SSELRVDLVD		FEGNHQFAKY		KSFKVADEAE		KYKLVLGAFV		GGSAGNSLTG
HNNNFFSTKD		QDNDVSSSNC		AEKFQGAWWY		ADCHASNLNG		LYLMGPHESY
ANGINWSAAK		GYKYSYKVSE		MKVRPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Lu J., Tay P.N., Kon O.L., Reid K.B. (1996). Human ficolin: cDNA cloning, demonstration of peripheral blood leucocytes as the major site of synthesis and assignment of the gene to chromosome 9. Biochem. J. 313: 473—478. PMID 8573080 DOI:10.1042/bj3130473
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Tanio M., Kondo S., Sugio S., Kohno T. (2007). Trivalent recognition unit of innate immunity system: crystal structure of trimeric human M-ficolin fibrinogen-like domain. J. Biol. Chem. 282: 3889—3895. PMID 17148457 DOI:10.1074/jbc.M608627200

Див. також

• Хромосома 9