FIP1L1

FIP1L1
Ідентифікатори
Символи	FIP1L1, FIP1, Rhe, hFip1, factor interacting with PAPOLA and CPSF1
Зовнішні ІД	OMIM: 607686 HomoloGene: 134000 GeneCards: FIP1L1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • mRNA export from nucleus • mRNA polyadenylation • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81608	289582
Ensembl	ENSG00000145216	ENSRNOG00000002275
UniProt	Q6UN15	Q5U317
RefSeq (мРНК)	NM_001134937 NM_001134938 NM_030917	NM_001008295
RefSeq (білок)	NP_001128409 NP_001128410 NP_112179 NP_001363673 NP_001363674 NP_001363675 NP_001363676 NP_001363677 NP_001363678 NP_001363679 NP_001363680 NP_001363681 NP_001363682 NP_001363683 NP_001363684 NP_001363685 NP_001363686 NP_001363687 NP_001363688 NP_001363689 NP_001363690 NP_001363691 NP_001363693 NP_001363694 NP_001363695 NP_001363696 NP_001363697 NP_001363698 NP_001363699 NP_001363700 NP_001363701 NP_001363702 NP_001363703 NP_001363704 NP_001363705 NP_001363706 NP_001363707 NP_001363708 NP_001363709 NP_001363710 NP_001363711 NP_001363712 NP_001363713 NP_001363714 NP_001363715	NP_001008296
Локус (UCSC)	Хр. 4: 53.38 – 53.46 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FIP1L1 (англ. Factor interacting with PAPOLA and CPSF1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 594 амінокислот, а молекулярна маса — 66 526.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSAGEVERLV		SELSGGTGGD		EEEEWLYGGP		WDVHVHSDLA		KDLDENEVER
PEEENASANP		PSGIEDETAE		NGVPKPKVTE		TEDDSDSDSD		DDEDDVHVTI
GDIKTGAPQY		GSYGTAPVNL		NIKTGGRVYG		TTGTKVKGVD		LDAPGSINGV
PLLEVDLDSF		EDKPWRKPGA		DLSDYFNYGF		NEDTWKAYCE		KQKRIRMGLE
VIPVTSTTNK		ITAEDCTMEV		TPGAEIQDGR		FNLFKVQQGR		TGNSEKETAL
PSTKAEFTSP		PSLFKTGLPP		SRNSTSSQSQ		TSTASRKANS		SVGKWQDRYG
RAESPDLRRL		PGAIDVIGQT		ITISRVEGRR		RANENSNIQV		LSERSATEVD
NNFSKPPPFF		PPGAPPTHLP		PPPFLPPPPT		VSTAPPLIPP		PGFPPPPGAP
PPSLIPTIES		GHSSGYDSRS		ARAFPYGNVA		FPHLPGSAPS		WPSLVDTSKQ
WDYYARREKD		RDRERDRDRE		RDRDRDRERE		RTRERERERD		HSPTPSVFNS
DEERYRYREY		AERGYERHRA		SREKEERHRE		RRHREKEETR		HKSSRSNSRR
RHESEEGDSH		RRHKHKKSKR		SKEGKEAGSE		PAPEQESTEA		TPAE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Griffin J.H., Leung J., Bruner R.J., Caligiuri M.A., Briesewitz R. (2003). Discovery of a fusion kinase in EOL-1 cells and idiopathic hypereosinophilic syndrome. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 7830—7835. PMID 12808148 DOI:10.1073/pnas.0932698100

Див. також

• Хромосома 4