FKBP8

FKBP8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2AWG, 2D9F, 2F2D, 2MF9, 3EY6
Ідентифікатори
Символи	FKBP8, FKBP38, FKBPr38, FK506 binding protein 8, FKBP prolyl isomerase 8
Зовнішні ІД	OMIM: 604840 MGI: 1341070 HomoloGene: 7720 GeneCards: FKBP8
Онтологія гена Молекулярна функція • FK506 binding • isomerase activity • peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • disordered domain specific binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • мітохондріальна мембрана • integral component of endoplasmic reticulum membrane • мітохондріальна оболонка • мітохондрія • ендоплазматичний ретикулум • гіалоплазма • цитоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0097285 апоптоз • GO:0007243 intracellular signal transduction • multicellular organism growth • cell fate specification • negative regulation of apoptotic process • regulation of BMP signaling pathway • neural tube development • positive regulation of BMP signaling pathway • регуляція експресії генів • smoothened signaling pathway • camera-type eye development • dorsal/ventral neural tube patterning • GO:0022415 viral process • dorsal/ventral pattern formation • chaperone-mediated protein folding • protein peptidyl-prolyl isomerization • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23770	14232
Ensembl	ENSG00000105701	ENSMUSG00000019428
UniProt	Q14318	O35465
RefSeq (мРНК)	NM_001308373 NM_012181	NM_001111066 NM_001199631 NM_010223
RefSeq (білок)	NP_001295302 NP_036313 NP_001295302.1	NP_001104536 NP_001186560 NP_034353
Локус (UCSC)	Хр. 19: 18.53 – 18.54 Mb	Хр. 8: 70.98 – 70.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FKBP8 (англ. FK506 binding protein 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 412 амінокислот, а молекулярна маса — 44 562.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASCAEPSEP		SAPLPAGVPP		LEDFEVLDGV		EDAEGEEEEE		EEEEEEDDLS
ELPPLEDMGQ		PPAEEAEQPG		ALAREFLAAM		EPEPAPAPAP		EEWLDILGNG
LLRKKTLVPG		PPGSSRPVKG		QVVTVHLQTS		LENGTRVQEE		PELVFTLGDC
DVIQALDLSV		PLMDVGETAM		VTADSKYCYG		PQGRSPYIPP		HAALCLEVTL
KTAVDGPDLE		MLTGQERVAL		ANRKRECGNA		HYQRADFVLA		ANSYDLAIKA
ITSSAKVDMT		FEEEAQLLQL		KVKCLNNLAA		SQLKLDHYRA		ALRSCSLVLE
HQPDNIKALF		RKGKVLAQQG		EYSEAIPILR		AALKLEPSNK		TIHAELSKLV
KKHAAQRSTE		TALYRKMLGN		PSRLPAKCPG		KGAWSIPWKW		LFGATAVALG
GVALSVVIAA		RN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, ротамаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, мітохондрії.

Література

• Shirane M., Nakayama K.I. (2003). Inherent calcineurin inhibitor FKBP38 targets Bcl-2 to mitochondria and inhibits apoptosis. Nat. Cell Biol. 5: 28—37. PMID 12510191 DOI:10.1038/ncb894
• Bulgakov O.V., Eggenschwiler J.T., Hong D.-H., Anderson K.V., Li T. (2004). FKBP8 is a negative regulator of mouse sonic hedgehog signaling in neural tissues. Development. 131: 2149—2159. PMID 15105374 DOI:10.1242/dev.01122
• Chen Y., Sternberg P., Cai J. (2008). Characterization of a Bcl-XL-interacting protein FKBP8 and its splice variant in human RPE cells. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 49: 1721—1727. PMID 18385096 DOI:10.1167/iovs.07-1121
• Lam E., Martin M., Wiederrecht G. (1995). Isolation of a cDNA encoding a novel human FK506-binding protein homolog containing leucine zipper and tetratricopeptide repeat motifs. Gene. 160: 297—302. PMID 7543869 DOI:10.1016/0378-1119(95)00216-S
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kang C.B., Feng L., Chia J., Yoon H.S. (2005). Molecular characterization of FK-506 binding protein 38 and its potential regulatory role on the anti-apoptotic protein Bcl-2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 337: 30—38. PMID 16176796 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.09.023

Див. також

• Хромосома 19