FMN1

FMN1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JUP, 2RLY, 2RM0
Ідентифікатори
Символи	FMN1, FMN, LD, formin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 136535 MGI: 101815 HomoloGene: 121778 GeneCards: FMN1
Пов'язані генетичні захворювання
рак сечового міхура
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • microtubule binding • actin binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • microtubule cytoskeleton • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • мікрофіламент • клітинне ядро • endoplasmic reticulum membrane Біологічний процес • forelimb morphogenesis • actin nucleation • експресія генів • positive regulation of actin filament polymerization • dendrite morphogenesis • розвиток нирки • skeletal system morphogenesis • ureteric bud invasion • hindlimb morphogenesis • positive regulation of actin nucleation • limb development • positive regulation of focal adhesion assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	342184	14260
Ensembl	ENSG00000248905	ENSMUSG00000044042
UniProt	Q68DA7	Q05860
RefSeq (мРНК)	NM_001103184 NM_001277313 NM_001277314 NM_198500	NM_001043322 NM_001285458 NM_001285459 NM_001287817 NM_001287818 NM_010230
RefSeq (білок)	NP_001096654 NP_001264242 NP_001264243	NP_001272387 NP_001272388 NP_001274746 NP_001274747 NP_034360
Локус (UCSC)	Хр. 15: 32.77 – 33.19 Mb	Хр. 2: 113.16 – 113.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FMN1 (англ. Formin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 419 амінокислот, а молекулярна маса — 157 578.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEGTHCTLQL		HKPITELCYI		SFCLPKGEVR		GFSYKGTVTL		DRSNKGFHNC
YQVREESDII		SLSQEPDEHP		GDIFFKQTPT		KDILTELYKL		TTERERLLTN
LLSSDHILGI		TMGNQEGKLQ		ELSVSLAPED		DCFQSAGDWQ		GELPVGPLNK
RSTHGNKKPR		RSSGRRESFG		ALPQKRTKRK		GRGGRESAPL		MGKDKICSSH
SLPLSRTRPN		LWVLEEKGNL		LPNGALACSL		QRRESCPPDI		PKTPDTDLGF
GSFETAFKDT		GLGREVLPPD		CSSTEAGGDG		IRRPPSGLEH		QQTGLSESHQ
DPEKHPEAEK		DEMEKPAKRT		CKQKPVSKVV		AKVQDLSSQV		QRVVKTHSKG
KETIAIRPAA		HAEFVPKADL		LTLPGAEAGA		HGSRRQGKER		QGDRSSQSPA
GETASISSVS		ASAEGAVNKV		PLKVIESEKL		DEAPEGKRLG		FPVHTSVPHT
RPETRNKRRA		GLPLGGHKSL		FLDLPHKVGP		DSSQPRGDKK		KPSPPAPAAL
GKVFNNSASQ		SSTHKQTSPV		PSPLSPRLPS		PQQHHRILRL		PALPGEREAA
LNDSPCRKSR		VFSGCVSADT		LEPPSSAKVT		ETKGASPAFL		RAGQPRLVPG
ETLEKSLGPG		KTTAEPQHQS		PPGISSEGFP		WDGFNEQTPK		DLPNRDGGAW
VLGYRAGPAC		PFLLHEEREK		SNRSELYLDL		HPDHSLTEQD		DRTPGRLQAV
WPPPKTKDTE		EKVGLKYTEA		EYQAAILHLK		REHKEEIENL		QAQFELRAFH
IRGEHAMITA		RLEETIENLK		HELEHRWRGG		CEERKDVCIS		TDDDCPPKTF
RNVCVQTDRE		TFLKPCESES		KTTRSNQLVP		KKLNISSLSQ		LSPPNDHKDI
HAALQPMEGM		ASNQQKALPP		PPASIPPPPP		LPSGLGSLSP		APPMPPVSAG
PPLPPPPPPP		PPLPPPSSAG		PPPPPPPPPL		PNSPAPPNPG		GPPPAPPPPG
LAPPPPPGLF		FGLGSSSSQC		PRKPAIEPSC		PMKPLYWTRI		QISDRSQNAT
PTLWDSLEEP		DIRDPSEFEY		LFSKDTTQQK		KKPLSETYEK		KNKVKKIIKL
LDGKRSQTVG		ILISSLHLEM		KDIQQAIFNV		DDSVVDLETL		AALYENRAQE
DELVKIRKYY		ETSKEEELKL		LDKPEQFLHE		LAQIPNFAER		AQCIIFRSVF
SEGITSLHRK		VEIITRASKD		LLHVKSVKDI		LALILAFGNY		MNGGNRTRGQ
ADGYSLEILP		KLKDVKSRDN		GINLVDYVVK		YYLRYYDQEA		GTEKSVFPLP
EPQDFFLASQ		VKFEDLIKDL		RKLKRQLEAS		EKQMVVVCKE		SPKEYLQPFK
DKLEEFFQKA		KKEHKMEESH		LENAQKSFET		TVRYFGMKPK		SGEKEITPSY
VFMVWYEFCS		DFKTIWKRES		KNISKERLKM		AQESVSKLTS		EKKVETKKIN
PTASLKERLR		QKEASVTTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katoh M., Katoh M. (2004). Identification and characterization of the human FMN1 gene in silico. Int. J. Mol. Med. 14: 121—126. PMID 15202026

Див. також

• Хромосома 15