FOXD1

FOXD1
Ідентифікатори
Символи	FOXD1, FKHL8, FREAC-4, FREAC4, forkhead box D1
Зовнішні ІД	OMIM: 601091 MGI: 1347463 HomoloGene: 3290 GeneCards: FOXD1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding, bending • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • branching involved in ureteric bud morphogenesis • розвиток нирки • transcription by RNA polymerase II • axon guidance • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of BMP signaling pathway • luteinizing hormone secretion • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • dichotomous subdivision of terminal units involved in ureteric bud branching • nephrogenic mesenchyme development • metanephric nephron development • metanephric capsule development • metanephric capsule specification • pattern specification involved in metanephros development • positive regulation of kidney development • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2297	15229
Ensembl	ENSG00000251493	н/д
UniProt	Q16676	Q61345
RefSeq (мРНК)	NM_004472	NM_008242
RefSeq (білок)	NP_004463	NP_032268
Локус (UCSC)	Хр. 5: 73.44 – 73.45 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXD1 (англ. Forkhead box D1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 46 140.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTLSTEMSDA		SGLAEETDID		VVGEGEDEED		EEEEDDDEGG		GGGPRLAVPA
QRRRRRRSYA		GEDELEDLEE		EEDDDDILLA		PPAGGSPAPP		GPAPAAGAGA
GGGGGGGGAG		GGGSAGSGAK		NPLVKPPYSY		IALITMAILQ		SPKKRLTLSE
ICEFISGRFP		YYREKFPAWQ		NSIRHNLSLN		DCFVKIPREP		GNPGKGNYWT
LDPESADMFD		NGSFLRRRKR		FKRQPLLPPN		AAAAESLLLR		GAGAAGGAGD
PAAAAALFPP		APPPPPHAYG		YGPYGCGYGL		QLPPYAPPSA		LFAAAAAAAA
AAAFHPHSPP		PPPPPHGAAA		ELARTAFGYR		PHPLGAALPG		PLPASAAKAG
GPGASALARS		PFSIESIIGG		SLGPAAAAAA		AAQAAAAAQA		SPSPSPVAAP
PAPGSSGGGC		AAQAAVGPAA		ALTRSLVAAA		AAAASSVSSS		AALGTLHQGT
ALSSVENFTA		RISNC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066

Див. також

• Хромосома 5