FRG1

FRG1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YUG
Ідентифікатори
Символи	FRG1, FRG1A, FSG1, FSHD region gene 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601278 MGI: 893597 HomoloGene: 3295 GeneCards: FRG1
Онтологія гена Молекулярна функція • actin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin filament binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Тільце Кахаля • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • Z disc • клітинне ядро • striated muscle dense body • ядерце Біологічний процес • rRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome • muscle organ development • mRNA processing • ribosome biogenesis • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2483	14300
Ensembl	ENSG00000275145 ENSG00000283153 ENSG00000109536 ENSG00000283630	ENSMUSG00000031590
UniProt	Q14331	P97376
RefSeq (мРНК)	NM_004477	NM_013522
RefSeq (білок)	NP_004468	NP_038550
Локус (UCSC)	Хр. 4: 189.94 – 189.96 Mb	Хр. 8: 41.85 – 41.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FRG1 (англ. FSHD region gene 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 29 172.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEYSYVKST		KLVLKGTKTK		SKKKKSKDKK		RKREEDEETQ		LDIVGIWWTV
TNFGEISGTI		AIEMDKGTYI		HALDNGLFTL		GAPHKEVDEG		PSPPEQFTAV
KLSDSRIALK		SGYGKYLGIN		SDGLVVGRSD		AIGPREQWEP		VFQNGKMALL
ASNSCFIRCN		EAGDIEAKSK		TAGEEEMIKI		RSCAERETKK		KDDIPEEDKG
NVKQCEINYV		KKFQSFQDHK		LKISKEDSKI		LKKARKDGFL		HETLLDRRAK
LKADRYCK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, процесинг рРНК, біогенез рибосом, міогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 4