GALNT16

GALNT16
Ідентифікатори
Символи	GALNT16, GALNACT16, GALNTL1, GalNAc-T16, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16
Зовнішні ІД	OMIM: 615132 MGI: 1917754 HomoloGene: 18907 GeneCards: GALNT16
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • glycosyltransferase activity • polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана Біологічний процес • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein O-linked glycosylation via serine • protein O-linked glycosylation via threonine Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57452	108760
Ensembl	ENSG00000100626	ENSMUSG00000021130
UniProt	Q8N428	Q9JJ61
RefSeq (мРНК)	NM_001168368 NM_020692	NM_001081421 NM_001361700 NM_001361701 NM_134045
RefSeq (білок)	NP_001161840 NP_065743	NP_001074890 NP_001348629 NP_001348630
Локус (UCSC)	Хр. 14: 69.26 – 69.36 Mb	Хр. 12: 80.57 – 80.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GALNT16 (англ. Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 558 амінокислот, а молекулярна маса — 63 074.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRKIRANAIA		ILTVAWILGT		FYYLWQDNRA		HAASSGGRGA		QRAGRRSEQL
REDRTIPLIV		TGTPSKGFDE		KAYLSAKQLK		AGEDPYRQHA		FNQLESDKLS
PDRPIRDTRH		YSCPSVSYSS		DLPATSVIIT		FHNEARSTLL		RTVKSVLNRT
PANLIQEIIL		VDDFSSDPED		CLLLTRIPKV		KCLRNDRREG		LIRSRVRGAD
VAAATVLTFL		DSHCEVNTEW		LPPMLQRVKE		DHTRVVSPII		DVISLDNFAY
LAASADLRGG		FDWSLHFKWE		QIPLEQKMTR		TDPTRPIRTP		VIAGGIFVID
KSWFNHLGKY		DAQMDIWGGE		NFELSFRVWM		CGGSLEIVPC		SRVGHVFRKR
HPYNFPEGNA		LTYIRNTKRT		AEVWMDEYKQ		YYYEARPSAI		GKAFGSVATR
IEQRKKMNCK		SFRWYLENVY		PELTVPVKEA		LPGIIKQGVN		CLESQGQNTA
GDFLLGMGIC		RGSAKNPQPA		QAWLFSDHLI		QQQGKCLAAT		STLMSSPGSP
VILQMCNPRE		GKQKWRRKGS		FIQHSVSGLC		LETKPAQLVT		SKCQADAQAQ
QWQLLPHT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, лектинами, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Raman J., Guan Y., Perrine C.L., Gerken T.A., Tabak L.A. (2012). UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases: completion of the family tree. Glycobiology. 22: 768—777. PMID 22186971 DOI:10.1093/glycob/cwr183

Див. також

• Хромосома 14