GALNT18

GALNT18
Ідентифікатори
Символи	GALNT18, GALNACT18, GALNT15, GALNTL4, GalNAc-T15, GalNAc-T18, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18
Зовнішні ІД	OMIM: 615136 MGI: 2446239 HomoloGene: 18347 GeneCards: GALNT18
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • glycosyltransferase activity • polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • компонент клітини Біологічний процес • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation • protein O-linked glycosylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	374378	233733
Ensembl	ENSG00000110328	ENSMUSG00000038296
UniProt	Q6P9A2	Q8K1B9
RefSeq (мРНК)	NM_198516 NM_001363464	NM_173739 NM_001360903
RefSeq (білок)	NP_940918 NP_001350393	NP_776100 NP_001347832
Локус (UCSC)	Хр. 11: 11.27 – 11.62 Mb	Хр. 7: 111.07 – 111.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GALNT18 (англ. Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 561.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVCTRKTKTL		VSTCVILSGM		TNIICLLYVG		WVTNYIASVY		VRGQEPAPDK
KLEEDKGDTL		KIIERLDHLE		NVIKQHIQEA		PAKPEEAEAE		PFTDSSLFAH
WGQELSPEGR		RVALKQFQYY		GYNAYLSDRL		PLDRPLPDLR		PSGCRNLSFP
DSLPEVSIVF		IFVNEALSVL		LRSIHSAMER		TPPHLLKEII		LVDDNSSNEE
LKEKLTEYVD		KVNSQKPGFI		KVVRHSKQEG		LIRSRVSGWR		AATAPVVALF
DAHVEFNVGW		AEPVLTRIKE		NRKRIISPSF		DNIKYDNFEI		EEYPLAAQGF
DWELWCRYLN		PPKAWWKLEN		STAPIRSPAL		IGCFIVDRQY		FQEIGLLDEG
MEVYGGENVE		LGIRVWQCGG		SVEVLPCSRI		AHIERAHKPY		TEDLTAHVRR
NALRVAEVWM		DEFKSHVYMA		WNIPQEDSGI		DIGDITARKA		LRKQLQCKTF
RWYLVSVYPE		MRMYSDIIAY		GVLQNSLKTD		LCLDQGPDTE		NVPIMYICHG
MTPQNVYYTS		SQQIHVGILS		PTVDDDDNRC		LVDVNSRPRL		IECSYAKAKR
MKLHWQFSQG		GPIQNRKSKR		CLELQENSDL		EFGFQLVLQK		CSGQHWSITN
VLRSLAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, глікозилтрансфераз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, лектинами, іоном марганцю. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Raman J., Guan Y., Perrine C.L., Gerken T.A., Tabak L.A. (2012). UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferases: completion of the family tree. Glycobiology. 22: 768—777. PMID 22186971 DOI:10.1093/glycob/cwr183

Див. також

• Хромосома 11