GAR1

GAR1
Ідентифікатори
Символи	GAR1, NOLA1, Nucleolar protein, member A1, GAR1 ribonucleoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 606468 MGI: 1930948 HomoloGene: 137420 GeneCards: GAR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • telomerase RNA binding • box H/ACA snoRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • box H/ACA snoRNP complex • Тільце Кахаля • box H/ACA telomerase RNP complex • box H/ACA scaRNP complex • клітинне ядро • telomerase holoenzyme complex • нуклеоплазма • fibrillar center • ядерце Біологічний процес • rRNA processing • pseudouridine synthesis • telomere maintenance via telomerase • ribosome biogenesis • rRNA pseudouridine synthesis • snoRNA guided rRNA pseudouridine synthesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54433	68147
Ensembl	ENSG00000109534	ENSMUSG00000028010
UniProt	Q9NY12	Q9CY66
RefSeq (мРНК)	NM_032993 NM_018983	NM_026578
RefSeq (білок)	NP_061856 NP_127460	NP_080854
Локус (UCSC)	Хр. 4: 109.82 – 109.82 Mb	Хр. 3: 129.62 – 129.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GAR1 (англ. GAR1 ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 22 348.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFRGGGRGG		FNRGGGGGGF		NRGGSSNHFR		GGGGGGGGGN		FRGGGRGGFG
RGGGRGGFNK		GQDQGPPERV		VLLGEFLHPC		EDDIVCKCTT		DENKVPYFNA
PVYLENKEQI		GKVDEIFGQL		RDFYFSVKLS		ENMKASSFKK		LQKFYIDPYK
LLPLQRFLPR		PPGEKGPPRG		GGRGGRGGGR		GGGGRGGGRG		GGFRGGRGGG
GGGFRGGRGG		GFRGRGH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесинг рРНК, біогенез рибосом, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Dragon F., Pogacic V., Filipowicz W. (2000). In vitro assembly of human H/ACA small nucleolar RNPs reveals unique features of U17 and telomerase RNAs. Mol. Cell. Biol. 20: 3037—3048. PMID 10757788 DOI:10.1128/MCB.20.9.3037-3048.2000
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pellizzoni L., Baccon J., Charroux B., Dreyfuss G. (2001). The survival of motor neurons (SMN) protein interacts with the snoRNP proteins fibrillarin and GAR1. Curr. Biol. 11: 1079—1088. PMID 11509230 DOI:10.1016/S0960-9822(01)00316-5
• Wang C., Meier U.T. (2004). Architecture and assembly of mammalian H/ACA small nucleolar and telomerase ribonucleoproteins. EMBO J. 23: 1857—1867. PMID 15044956 DOI:10.1038/sj.emboj.7600181

Див. також

• Хромосома 4