GBF1

GBF1
Ідентифікатори
Символи	GBF1, ARF1GEF, golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1, CMT2GG
Зовнішні ІД	OMIM: 603698 MGI: 1861607 HomoloGene: 37897 GeneCards: GBF1
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding • lipid binding Клітинна компонента • lipid droplet • Golgi membrane • trans-Golgi network • cell leading edge • пероксисома • цитоплазма • endoplasmic reticulum lumen • Golgi stack • мітохондрія • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • cis-Golgi network • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment Біологічний процес • Golgi disassembly • protein localization to endoplasmic reticulum tubular network • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • protein transport • Golgi organization • GO:0022415 viral process • regulation of mitotic cell cycle • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment organization • post-Golgi vesicle-mediated transport • establishment of monopolar cell polarity • protein localization to endoplasmic reticulum exit site • regulation of protein localization to cell surface • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • cell activation involved in immune response • protein localization to Golgi apparatus • neutrophil chemotaxis • reactive oxygen species biosynthetic process • retrograde transport, endosome to Golgi • Golgi to endosome transport • regulation of ARF protein signal transduction • COPI coating of Golgi vesicle • GO:0015915 транспорт • regulation of molecular function Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8729	107338
Ensembl	ENSG00000107862	ENSMUSG00000025224
UniProt	Q92538	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001199378 NM_001199379 NM_004193 NM_001377137 NM_001377138 NM_001377139 NM_001377140 NM_001377141 NM_001391922 NM_001391923 NM_001391924 NM_001391925 NM_001391926 NM_001391927 NM_001391928 NM_001391929 NM_001391930 NM_001391931	NM_178930
RefSeq (білок)	NP_001186307 NP_001186308 NP_004184	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 10: 102.25 – 102.38 Mb	Хр. 19: 46.14 – 46.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GBF1 (англ. Golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 859 амінокислот, а молекулярна маса — 206 446.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVDKNIYIIQ		GEINIVVGAI		KRNARWSTHT		PLDEERDPLL		HSFGHLKEVL
NSITELSEIE		PNVFLRPFLE		VIRSEDTTGP		ITGLALTSVN		KFLSYALIDP
THEGTAEGME		NMADAVTHAR		FVGTDPASDE		VVLMKILQVL		RTLLLTPVGA
HLTNESVCEI		MQSCFRICFE		MRLSELLRKS		AEHTLVDMVQ		LLFTRLPQFK
EEPKNYVGTN		MKKLKMRAGG		MSDSSKWKKQ		KRSPRPPRHM		TKVTPGSELP
TPNGTTLSSN		LTGGMPFIDV		PTPISSASSE		AASAVVSPST		DSGLEFSSQT
TSKEDLTDLE		QPGSPGYSTA		TEPGSSELGV		PEQPDLQEGT		HVEKSQSASV
ESIPEVLEEC		TSPADHSDSA		SVHDMDYVNP		RGVRFTQSSQ		KEGTALVPYG
LPCIRELFRF		LISLTNPHDR		HNSEVMIHMG		LHLLTVALES		APVAQCQTLL
GLIKDEMCRH		LFQLLSIERL		NLYAASLRVC		FLLFESMREH		LKFQMEMYIK
KLMEIITVEN		PKMPYEMKEM		ALEAIVQLWR		IPSFVTELYI		NYDCDYYCSN
LFEELTKLLS		KNAFPVSGQL		YTTHLLSLDA		LLTVIDSTEA		HCQAKVLNSL
TQQEKKETAR		PSCEIVDGTR		EASNTERTAS		DGKAVGMASD		IPGLHLPGGG
RLPPEHGKSG		CSDLEEAVDS		GADKKFARKP		PRFSCLLPDP		RELIEIKNKK
KLLITGTEQF		NQKPKKGIQF		LQEKGLLTIP		MDNTEVAQWL		RENPRLDKKM
IGEFVSDRKN		IDLLESFVST		FSFQGLRLDE		ALRLYLEAFR		LPGEAPVIQR
LLEAFTERWM		NCNGSPFANS		DACFSLAYAV		IMLNTDQHNH		NVRKQNAPMT
LEEFRKNLKG		VNGGKDFEQD		ILEDMYHAIK		NEEIVMPEEQ		TGLVRENYVW
NVLLHRGATP		EGIFLRVPTA		SYDLDLFTMT		WGPTIAALSY		VFDKSLEETI
IQKAISGFRK		CAMISAHYGL		SDVFDNLIIS		LCKFTALSSE		SIENLPSVFG
SNPKAHIAAK		TVFHLAHRHG		DILREGWKNI		MEAMLQLFRA		QLLPKAMIEV
EDFVDPNGKI		SLQREETPSN		RGESTVLSFV		SWLTLSGPEQ		SSVRGPSTEN
QEAKRVALEC		IKQCDPEKMI		TESKFLQLES		LQELMKALVS		VTPDEETYDE
EDAAFCLEML		LRIVLENRDR		VGCVWQTVRD		HLYHLCVQAQ		DFCFLVERAV
VGLLRLAIRL		LRREEISAQV		LLSLRILLLM		KPSVLSRVSH		QVAYGLHELL
KTNAANIHSG		DDWATLFTLL		ECIGSGVKPP		AALQATARAD		APDAGAQSDS
ELPSYHQNDV		SLDRGYTSDS		EVYTDHGRPG		KIHRSATDAD		VVNSGWLVVG
KDDVDNSKPG		PSRPGPSPLI		NQYSLTVGLD		LGPHDTKSLL		KCVESLSFIV
RDAAHITPDN		FELCVKTLRI		FVEASLNGGC		KSQEKRGKSH		KYDSKGNRFK
KKSKEGSMLR		RPRTSSQHAS		RGGQSDDDED		EGVPASYHTV		SLQVSQDLLD
LMHTLHTRAA		SIYSSWAEEQ		RHLETGGQKI		EADSRTLWAH		CWCPLLQGIA
CLCCDARRQV		RMQALTYLQR		ALLVHDLQKL		DALEWESCFN		KVLFPLLTKL
LENISPADVG		GMEETRMRAS		TLLSKVFLQH		LSPLLSLSTF		AALWLTILDF
MDKYMHAGSS		DLLSEAIPES		LKNMLLVMDT		AEIFHSADAR		GGGPSALWEI
TWERIDCFLP		HLRDELFKQT		VIQDPMPMEP		QGQKPLASAH		LTSAAGDTRT
PGHPPPPEIP		SELGACDFEK		PESPRAASSS		SPGSPVASSP		SRLSPTPDGP
PPLAQPPLIL		QPLASPLQVG		VPPMTLPIIL		NPALIEATSP		VPLLATPRPT
DPIPTSEVN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ліпідних краплях, апараті гольджі.

Література

• Mansour S.J., Herbrick J.-A., Scherer S.W., Melancon P. (1998). Human GBF1 is a ubiquitously expressed gene of the sec7 domain family mapping to 10q24. Genomics. 54: 323—327. PMID 9828135 DOI:10.1006/geno.1998.5563
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Garcia-Mata R., Sztul E. (2003). The membrane-tethering protein p115 interacts with GBF1, an ARF guanine-nucleotide-exchange factor. EMBO Rep. 4: 320—325. PMID 12634853 DOI:10.1038/sj.embor.embor762
• Garcia-Mata R., Szul T., Alvarez C., Sztul E. (2003). ADP-ribosylation factor/COPI-dependent events at the endoplasmic reticulum-Golgi interface are regulated by the guanine nucleotide exchange factor GBF1. Mol. Biol. Cell. 14: 2250—2261. PMID 12808027 DOI:10.1091/mbc.E02-11-0730
• Niu T.K., Pfeifer A.C., Lippincott-Schwartz J., Jackson C.L. (2005). Dynamics of GBF1, a Brefeldin A-sensitive Arf1 exchange factor at the Golgi. Mol. Biol. Cell. 16: 1213—1222. PMID 15616190 DOI:10.1091/mbc.E04-07-0599
• Monetta P., Slavin I., Romero N., Alvarez C. (2007). Rab1b interacts with GBF1 and modulates both ARF1 dynamics and COPI association. Mol. Biol. Cell. 18: 2400—2410. PMID 17429068 DOI:10.1091/mbc.E06-11-1005

Див. також

• Хромосома 10