GIMAP1

GIMAP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3V70
Ідентифікатори
Символи	GIMAP1, HIMAP1, IAN2, IMAP1, IMAP38, GTPase, IMAP family member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608084 MGI: 109368 HomoloGene: 7379 GeneCards: GIMAP1
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	170575	16205
Ensembl	ENSG00000213203	ENSMUSG00000090019
UniProt	Q8WWP7	P70224
RefSeq (мРНК)	NM_130759	NM_008376 NM_175860
RefSeq (білок)	NP_570115	NP_032402 NP_787056
Локус (UCSC)	Хр. 7: 150.72 – 150.72 Mb	Хр. 6: 48.72 – 48.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GIMAP1 (англ. GTPase, IMAP family member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 306 амінокислот, а молекулярна маса — 34 369.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGGRKMATDE		ENVYGLEENA		QSRQESTRRL		ILVGRTGAGK		SATGNSILGQ
RRFFSRLGAT		SVTRACTTGS		RRWDKCHVEV		VDTPDIFSSQ		VSKTDPGCEE
RGHCYLLSAP		GPHALLLVTQ		LGRFTAQDQQ		AVRQVRDMFG		EDVLKWMVIV
FTRKEDLAGG		SLHDYVSNTE		NRALRELVAE		CGGRVCAFDN		RATGREQEAQ
VEQLLGMVEG		LVLEHKGAHY		SNEVYELAQV		LRWAGPEERL		RRVAERVAAR
VQRRPWGAWL		SARLWKWLKS		PRSWRLGLAL		LLGGALLFWV		LLHRRWSEAV
AEVGPD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Stamm O., Kruecken J., Schmitt-Wrede H.-P., Benten W.P.M., Wunderlich F. (2002). Human ortholog to mouse gene imap38 encoding an ER-localizable G-protein belongs to a gene family clustered on chromosome 7q32-36. Gene. 282: 159—167. PMID 11814688 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00837-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7