GPC1

GPC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ACR, 4AD7, 4BWE, 4YWT
Ідентифікатори
Символи	GPC1, glypican, Glypican 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600395 MGI: 1194891 HomoloGene: 20477 GeneCards: GPC1
Онтологія гена Молекулярна функція • fibroblast growth factor binding • heparan sulfate proteoglycan binding • copper ion binding • laminin binding Клітинна компонента • ендосома • мембрана • integral component of plasma membrane • lysosomal lumen • Golgi lumen • membrane raft • anchored component of membrane • екзосома • міжклітинний простір • нуклеоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • intrinsic component of plasma membrane • синапс • anchored component of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix • cell surface Біологічний процес • glycosaminoglycan metabolic process • myelin assembly • heparan sulfate proteoglycan catabolic process • retinoid metabolic process • axon guidance • negative regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of skeletal muscle cell differentiation • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • Schwann cell differentiation • leukocyte migration • regulation of signal transduction • cell migration • regulation of protein localization to membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2817	14733
Ensembl	ENSG00000063660	ENSMUSG00000034220
UniProt	P35052	Q9QZF2
RefSeq (мРНК)	NM_002081	NM_016696
RefSeq (білок)	NP_002072	NP_057905
Локус (UCSC)	Хр. 2: 240.44 – 240.47 Mb	Хр. 1: 92.76 – 92.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GPC1 (англ. Glypican 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 558 амінокислот, а молекулярна маса — 61 680.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELRARGWWL		LCAAAALVAC		ARGDPASKSR		SCGEVRQIYG		AKGFSLSDVP
QAEISGEHLR		ICPQGYTCCT		SEMEENLANR		SHAELETALR		DSSRVLQAML
ATQLRSFDDH		FQHLLNDSER		TLQATFPGAF		GELYTQNARA		FRDLYSELRL
YYRGANLHLE		ETLAEFWARL		LERLFKQLHP		QLLLPDDYLD		CLGKQAEALR
PFGEAPRELR		LRATRAFVAA		RSFVQGLGVA		SDVVRKVAQV		PLGPECSRAV
MKLVYCAHCL		GVPGARPCPD		YCRNVLKGCL		ANQADLDAEW		RNLLDSMVLI
TDKFWGTSGV		ESVIGSVHTW		LAEAINALQD		NRDTLTAKVI		QGCGNPKVNP
QGPGPEEKRR		RGKLAPRERP		PSGTLEKLVS		EAKAQLRDVQ		DFWISLPGTL
CSEKMALSTA		SDDRCWNGMA		RGRYLPEVMG		DGLANQINNP		EVEVDITKPD
MTIRQQIMQL		KIMTNRLRSA		YNGNDVDFQD		ASDDGSGSGS		GDGCLDDLCS
RKVSRKSSSS		RTPLTHALPG		LSEQEGQKTS		AASCPQPPTF		LLPLLLFLAL
TVARPRWR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном міді, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендосомах. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mani K., Cheng F., Fransson L.A. (2006). Defective nitric oxide-dependent, deaminative cleavage of glypican-1 heparan sulfate in Niemann-Pick C1 fibroblasts. Glycobiology. 16: 711—718. PMID 16645004 DOI:10.1093/glycob/cwj121
• Mani K., Cheng F., Fransson L.A. (2006). Constitutive and vitamin C-induced, NO-catalyzed release of heparan sulfate from recycling glypican-1 in late endosomes. Glycobiology. 16: 1251—1261. PMID 16971378 DOI:10.1093/glycob/cwl045
• Svensson G., Linse S., Mani K. (2009). Chemical and thermal unfolding of glypican-1: protective effect of heparan sulfate against heat-induced irreversible aggregation. Biochemistry. 48: 9994—10004. PMID 19775117 DOI:10.1021/bi901402x
• Svensson G., Mani K. (2009). S-Nitrosylation of secreted recombinant human glypican-1. Glycoconj. J. 26: 1247—1257. PMID 19479373 DOI:10.1007/s10719-009-9243-z
• Taylor D.R., Whitehouse I.J., Hooper N.M. (2009). Glypican-1 mediates both prion protein lipid raft association and disease isoform formation. PLoS Pathog. 5: E1000666—E1000666. PMID 19936054 DOI:10.1371/journal.ppat.1000666

Див. також

• Хромосома 2