GTF2H2C

GTF2H2C
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Z60, 5IVW, 5IY9, 5IY8, 5IY7, 5IY6,%%s1Z60
Ідентифікатори
Символи	GTF2H2C, GTF2H2C_2, GTF2H2 family member C
Зовнішні ІД	GeneCards: GTF2H2C
Онтологія гена Молекулярна функція • protein kinase activity • ATP-dependent activity, acting on DNA • protein N-terminus binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • translation factor activity, RNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity • nucleic acid binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • transcription factor TFIIH holo complex • GO:0000441 transcription factor TFIIH core complex • core TFIIH complex portion of holo TFIIH complex • клітинне ядро • transcription factor TFIID complex • nuclear speck Біологічний процес • termination of RNA polymerase I transcription • G protein-coupled receptor internalization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • 7-methylguanosine mRNA capping • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • global genome nucleotide-excision repair • transcription-coupled nucleotide-excision repair • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • nucleotide-excision repair, DNA incision • response to UV • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • GO:0100026 Репарація ДНК • Біосинтез білків • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • nucleotide-excision repair, preincision complex stabilization • protein phosphorylation • nucleotide-excision repair • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA helicase activity • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 3'-to lesion • GO:0001183 transcription elongation from RNA polymerase I promoter Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	728340	н/д
Ensembl	ENSG00000183474	н/д
UniProt	Q13888 Q6P1K8	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001098728	н/д
RefSeq (білок)	NP_001506 NP_001351496 NP_001351497 NP_001351498 NP_001351499 NP_001351500 NP_001351501 NP_001351502 NP_001092198 NP_001362927 NP_001362928 NP_001362929 NP_001362930 NP_001362931 NP_001362932 NP_001362934 NP_001362935 NP_001035955 NP_001341366 NP_001341367 NP_001341368	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 5: 69.56 – 69.59 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

GTF2H2C (англ. General transcription factor IIH subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 44 419.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEEPERTKR		WEGGYERTWE		ILKEDESGSL		KATIEDILFK		AKRKRVFEHH
GQVRLGMMRH		LYVVVDGSRT		MEDQDLKPNR		LTCTLKLLEY		FVEEYFDQNP
ISQIGIIVTK		SKRAEKLTEL		SGNPRKHITS		LKKAVDMTCH		GEPSLYNSLS
IAMQTLKHMP		GHTSREVLII		FSSLTTCDPS		NIYDLIKTLK		AAKIRVSVIG
LSAEVRVCTV		LARETGGTYH		VILDESHYKE		LLTHHVSPPP		ASSSSECSLI
RMGFPQHTIA		SLSDQDAKPS		FSMAHLDGNT		EPGLTLGGYF		CPQCRAKYCE
LPVECKICGL		TLVSAPHLAR		SYHHLFPLDA		FQEIPLEEYN		GERFCYGCQG
ELKDQHVYVC		AVCQNVFCVD		CDVFVHDSLH		CCPGCIHKIP		APSGV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kershnar E., Wu S.-Y., Chiang C.-M. (1998). Immunoaffinity purification and functional characterization of human transcription factor IIH and RNA polymerase II from clonal cell lines that conditionally express epitope-tagged subunits of the multiprotein complexes. J. Biol. Chem. 273: 34444—34453. PMID 9852112 DOI:10.1074/jbc.273.51.34444
• Tremeau-Bravard A., Perez C., Egly J.-M. (2001). A role of the C-terminal part of p44 in the promoter escape activity of transcription factor IIH. J. Biol. Chem. 276: 27693—27697. PMID 11319235 DOI:10.1074/jbc.M102457200

Див. також

• Хромосома 5