H2AFY2

H2AFY2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XD7
Ідентифікатори
Символи	MACROH2A2, macroH2A2, H2A histone family member Y2, H2AFY2, macroH2A.2 histone
Зовнішні ІД	OMIM: 616141 MGI: 3037658 HomoloGene: 10246 GeneCards: MACROH2A2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity • chromatin DNA binding Клітинна компонента • ESC/E(Z) complex • Нуклеоплазма • хромосома • Нуклеосома • Хроматин • екзосома • Тільце Барра • клітинне ядро Біологічний процес • nucleosome assembly • negative regulation of transcription of nucleolar large rRNA by RNA polymerase I • positive regulation of keratinocyte differentiation • Дозова компенсація • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • establishment of protein localization to chromatin • brain development • negative regulation of gene expression, epigenetic • regulation of cell growth • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55506	404634
Ensembl	ENSG00000099284	ENSMUSG00000020086
UniProt	Q9P0M6	Q8CCK0
RefSeq (мРНК)	NM_018649	NM_207000
RefSeq (білок)	NP_061119	NP_996883
Локус (UCSC)	Хр. 10: 70.05 – 70.11 Mb	Хр. 10: 61.57 – 61.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

H2AFY2 (англ. H2A histone family member Y2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 40 058.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGRSGKKKM		SKLSRSARAG		VIFPVGRLMR		YLKKGTFKYR		ISVGAPVYMA
AVIEYLAAEI		LELAGNAARD		NKKARIAPRH		ILLAVANDEE		LNQLLKGVTI
ASGGVLPRIH		PELLAKKRGT		KGKSETILSP		PPEKRGRKAT		SGKKGGKKSK
AAKPRTSKKS		KPKDSDKEGT		SNSTSEDGPG		DGFTILSSKS		LVLGQKLSLT
QSDISHIGSM		RVEGIVHPTT		AEIDLKEDIG		KALEKAGGKE		FLETVKELRK
SQGPLEVAEA		AVSQSSGLAA		KFVIHCHIPQ		WGSDKCEEQL		EETIKNCLSA
AEDKKLKSVA		FPPFPSGRNC		FPKQTAAQVT		LKAISAHFDD		SSASSLKNVY
FLLFDSESIG		IYVQEMAKLD		AK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до регуляторів хроматину. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Chadwick B.P., Willard H.F. (2001). Histone H2A variants and the inactive X chromosome: identification of a second macroH2A variant. Hum. Mol. Genet. 10: 1101—1113. PMID 11331621 DOI:10.1093/hmg/10.10.1101
• Costanzi C., Pehrson J.R. (2001). MACROH2A2, a new member of the MACROH2A core histone family. J. Biol. Chem. 276: 21776—21784. PMID 11262398 DOI:10.1074/jbc.M010919200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 10